针对您提出的“虚开增值税专用发票罪违法所得怎么追缴”的问题，这是一个涉及法律、税务和侦查等多方面的复杂过程。以下是我为您详细梳理的追缴流程和相关法律依据：
一、法律依据与基本原则
法律依据：
- 《中华人民共和国刑法》明确规定了虚开增值税专用发票等犯罪行为的刑罚和财产刑，为追缴违法所得提供了法律基础。
- 《中华人民共和国税收征收管理法》等相关法律法规也规定了追缴税款、滞纳金和罚款的具体措施。
基本原则：
- 依法追缴：必须严格按照法律规定进行追缴，确保程序合法、证据确凿。
- 全面追缴：不仅要追缴直接犯罪所得，还要追缴通过犯罪所得产生的其他收益。
- 及时高效：追缴工作应迅速展开，防止犯罪所得被转移或隐匿。
二、追缴流程与方法
案件侦查与立案：
- 税务机关或公安机关在发现虚开增值税线索后，会立即展开调查，收集相关证据。
- 一旦证据确凿，将依法立案，启动追缴程序。
查封、扣押、冻结涉案财物：
- 在侦查过程中，为防止犯罪所得被转移或隐匿，侦查机关有权查封、扣押、冻结涉案财物，包括银行账户、房产、车辆等可能藏匿犯罪所得的资产。
评估与拍卖：
- 对于查封、扣押的财物，侦查机关会进行评估，确定其价值。
- 如果需要变现以抵缴税款或罚款，将通过拍卖等方式进行处理。
追缴税款与滞纳金：
- 税务机关有权追缴虚开的税款及滞纳金。滞纳金按日加收滞纳税款万分之五计算，直至税款全部缴清为止。
没收违法所得与罚款：
- 法院在判决时会没收虚开增值税的违法所得。
- 同时，根据犯罪情节的严重程度，还可能并处或者单处罚金。
国际合作与司法协助（如适用）：
- 如果虚开增值税犯罪涉及跨国犯罪或犯罪嫌疑人逃往境外，我国将积极寻求国际合作与司法协助，通过引渡、遣返、国际刑事司法合作等方式，追捕犯罪嫌疑人并追缴犯罪所得。
三、追缴过程中的注意事项
保护纳税人合法权益：
- 在追缴过程中，必须严格遵守法律规定，保护纳税人的合法权益不受侵犯。对于非涉案财物或合法收入，不得随意查封、扣押或冻结。
加强部门协作与信息共享：
- 税务机关、公安机关、银行等部门应加强协作与信息共享，形成合力打击虚开增值税犯罪。通过建立联合办案机制、信息共享平台等方式，提高追缴工作的效率和准确性。
考虑从宽情节：
- 如果犯罪分子在判决宣告前能如实供述自己罪行、真诚悔罪、积极退赃，并有效避免或减少损害结果的发生，可以从轻、减轻或者免除处罚。这也有助于追缴工作的顺利进行。
四、特殊情况说明
- 如果虚开税款数额不到10万元，且没有其他严重情节的，不构成虚开增值税专用发票罪，因此也不涉及违法所得的追缴。但税务机关仍可能根据《中华人民共和国税收征收管理法》等相关规定进行税务处理。
- 某些特定情况下的虚开行为，如为了虚增营业额、扩大销售收入而对开、环开增值税专用发票，但并未造成国家税款损失的，也可能不构成犯罪，因此不涉及违法所得的追缴。但这种情况仍需税务机关进行税务稽查和评估。
综上所述，虚开增值税专用发票罪违法所得的追缴是一个复杂而严谨的过程，需要税务机关、公安机关等多部门的协作与配合。如果您或您身边的人涉及此类问题，建议尽快咨询专业律师以获取准确的法律建议和指导。