针对您提出的“虚开增值税专用发票违法所得确认”的问题，以下是我为您提供的详细、清晰的解答。
首先，我们需要明确虚开增值税专用发票罪中“违法所得”的认定方式。在司法实践中，对于违法所得的认定主要有两种标准：毛利法和获利法。毛利法通常适用于诈骗罪、盗窃罪等类型的犯罪，计算时以行为人实际骗取的数额为准，包括为实施犯罪而支付的费用。而获利法则更适用于生产、销售伪劣产品罪、非法经营罪等类型的犯罪，计算时以行为人违法生产、销售商品或提供服务所获得的全部收入，扣除直接用于经营活动的合理支出部分后剩余的数额为准。
对于虚开增值税专用发票罪，由于其属于经济犯罪范畴，且通常涉及非法经营行为，因此在认定违法所得时更倾向于采用获利法。具体来说，违法所得应是指行为人通过虚开增值税专用发票行为所获利益或者避免的损失，即虚开增值税专用发票的非法经营数额扣除其直接用于支出部分后剩余的数额。
在确认虚开增值税专用发票的违法所得时，还需注意以下几点：
实际抵扣的税款：只给他人虚开销项增值税专用发票，受票单位利用虚开的增值税专用发票抵扣税款的，或者让他人为自己虚开进项增值税专用发票，自己用于正常经营中的抵扣税款的，一般只应计算销项或进项中实际抵扣的税款作为给国家利益造成的损失，这也应作为认定违法所得的重要参考。
无实际经营活动的虚开：对于一些无生产、销售经营活动的行为人在为他人虚开销项增值税专用发票以后，为了掩盖其向他人虚开的事实，又让他人为自己虚开进项增值税专用发票的情形，应以查实的销项增值税中被实际抵扣部分作为给国家利益造成的损失，并据此认定违法所得。
预缴税款和退赔款项的扣除：在认定虚开增值税专用发票犯罪给国家利益所造成的损失时，对于行为人为领取增值税专用发票向税务机关预缴的税款和行为人及其家属向国家退赔的款项，应从实际被非法抵扣的税款中予以扣除，这也会影响最终违法所得的数额。
综上所述，虚开增值税专用发票违法所得的确认是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多种因素。在实际操作中，建议咨询专业律师或相关机构以获取更准确的法律意见和帮助。