确认劳动关系期间工伤认定时限通常不会超过，但具体情况需结合实际情形判断。以下从不同角度为你详细分析：
工伤认定与劳动关系确认的关联
工伤认定过程中，劳动行政部门会对劳动者与用人单位之间是否存在劳动关系进行审查。一旦工伤被认定，就意味着劳动行政部门已经确认了劳动者与用人单位之间的劳动关系。因此，从某种程度上说，工伤认定本身包含了对劳动关系的确认。
若工伤认定前已确认劳动关系：
- 如果通过签订劳动合同、劳动仲裁裁决、法院判决等有效方式已经确认了劳动关系，那么之后就不存在再去确认劳动关系时效的问题。因为劳动关系已经明确，工伤认定可以直接基于这一明确的关系进行。
若工伤认定时未明确劳动关系：
- 如果在工伤认定时，劳动关系尚未明确，但凭借其他材料（如事故见证人的证言、工作证、工资单等）完成了工伤认定，此时从劳动者知道或应当知道权利被侵害之日起开始计算一年的仲裁时效，用于确认劳动关系。不过，由于工伤认定已经完成，这一时效的计算对工伤待遇的享受通常不构成实质性障碍。
时效的中断和中止
在确认劳动关系的仲裁过程中，时效可能会因为某些原因而中断或中止。
时效中断：
- 如果当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务，时效会中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。例如，劳动者在知道权利被侵害后的半年内向用人单位书面要求确认劳动关系，此时仲裁时效中断，并重新计算一年的时效。
时效中止：
- 如果因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在规定的仲裁时效期间申请仲裁，时效会中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。例如，劳动者遭遇自然灾害、突发重大疾病等不可抗力事件，导致无法在时效内申请仲裁，时效中止，待阻碍因素消除后，时效继续计算。
超过时效的法律后果及特殊规定
如果超过仲裁时效申请劳动仲裁确认劳动关系，仲裁委可能会以超过时效为由不予受理。即使进入实体审理，用人单位以超过仲裁时效进行抗辩，劳动者也可能会面临败诉风险。然而，值得注意的是：
- 法院审理的特殊性：法院在审理此类案件时，一般不会主动适用时效规定进行裁判，特别是当劳动关系是否存在与工资支付、福利待遇等紧密相关时。可以类比追索劳动报酬的情形，不受一年仲裁时效期间的限制。
- 工伤认定的特殊情形：即使确认劳动关系的仲裁超过时效，如果符合《工伤保险条例》中规定的特殊情形（如不可抗力、人身自由受限、社保部门或用人单位原因等），劳动者仍有可能在超过一年后提出工伤认定申请，并享受相应的工伤待遇。
实际操作建议
- 及时确认劳动关系：在发生工伤事故后，应尽快通过合法途径确认劳动关系，以避免后续可能出现的时效问题。
- 保留相关证据：无论劳动关系是否已经确认，都应保留好与工伤事故相关的所有证据材料，如医疗记录、证人证言、工作证、工资单等。
- 关注时效变化：密切关注仲裁时效的变化情况，如有需要，及时采取措施中断或中止时效。
综上所述，确认劳动关系期间工伤认定时限通常不会超过，但具体情况还需结合当地的法律法规和司法实践来判断。如果你有具体的法律需求或疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供更准确的法律意见和帮助。