确认劳动关系纠纷超过一年，在特定情形下仍可进行工伤认定。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与一般规定
根据《工伤保险条例》第十七条的规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。若用人单位未按时申请，工伤职工或者其近亲属、工会组织可在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内直接提出申请。这里的“1年”期限，是通常情况下的申请时限。
二、超过一年期限仍可受理的情形
因确认劳动关系导致的延误：
- 如果因确认劳动关系而进行了仲裁或诉讼，这些程序所花费的时间通常不计入工伤认定申请期限内。这意味着，即使确认劳动关系的纠纷耗时超过一年，只要劳动者在仲裁或诉讼结束后，携带生效的法律文书向社会保险行政部门申请工伤认定，部门应当受理。
存在合理事由导致时效中止、中断：
- 根据《最高人民法院关于审理工伤保险行政案件若干问题的规定》第七条，若因不属于职工或其近亲属自身原因（如不可抗力、人身自由受限、用人单位原因、社会保险行政部门登记制度不完善等）导致超期，被耽误的时间不计入申请期限内。
三、实践中的考量与建议
及时咨询与申请：
- 尽管存在上述宽容机制，但为避免不必要的麻烦和损失，建议劳动者在发生工伤事故后尽快启动工伤认定程序，并及时咨询专业律师（即向我咨询）以了解具体流程和所需材料。
保留完整证据：
- 劳动者应妥善保管与工伤相关的所有证据，包括医疗记录、事故现场照片、证人证言、劳动合同、工资单等，以及确认劳动关系的仲裁或诉讼文书。这些证据在申请工伤认定时至关重要。
积极配合调查：
- 在申请工伤认定过程中，劳动者应积极配合社会保险行政部门的调查工作，提供真实、准确的信息和材料。
考虑其他维权途径：
- 如果工伤认定途径受阻或超期，劳动者还可以考虑通过民事诉讼等方式主张民事侵权赔偿。但需注意，民事侵权赔偿与工伤赔偿在赔偿项目、标准上可能存在差异。
总结来说，确认劳动关系纠纷超过一年并不意味着无法进行工伤认定。只要劳动者能够证明延误是由于合理事由（如劳动关系争议处理）导致的，并且符合相关法律法规的规定，工伤认定部门仍可能受理其申请。因此，建议劳动者在遇到此类情况时保持冷静，积极收集证据并咨询专业律师（即向我咨询），以确保自身权益得到有效维护。