不动产证附记上有权籍调查审核专用章，不动产证仍然是合法有效的。以下从几个方面为你详细解释：

1. 权籍调查审核专用章的作用：

   • 权籍调查是不动产登记过程中的一个重要环节，它涉及对不动产的权属、位置、面积、用途等信息的核实和确认。
   • 权籍调查审核专用章是相关部门在完成权籍调查后，对调查结果进行审核并确认无误后加盖的印章。这个印章的存在，实际上是对不动产证上所载信息的一种官方认可和背书。

2. 不动产证的合法性：

   • 不动产证是证明不动产所有权或使用权的法律文件，其合法性主要取决于颁发机构的权威性和颁发程序的合法性。
   • 只要不动产证是由合法的登记机构按照法定程序颁发的，并且上面的信息准确无误，那么它就是合法有效的。权籍调查审核专用章的存在，并不会影响不动产证的合法性，反而增加了其可信度。

3. 可能存在的误解：

   • 有人可能会认为，不动产证上加盖了额外的印章，是否意味着原证存在问题或需要更新。实际上，这种理解是片面的。权籍调查审核专用章的加盖，往往是为了满足特定的管理需求或更新登记信息，而并非对原证合法性的否定。
   • 如果不动产证上的信息因为权籍调查而发生了变更（如面积、用途等），那么登记机构会相应地更新不动产证上的信息，并可能加盖权籍调查审核专用章以确认变更。但这并不改变不动产证本身的合法性。

4. 建议与注意事项：

   • 如果你对不动产证上的权籍调查审核专用章有疑问，或者担心不动产证的合法性受到影响，可以联系当地的登记机构进行咨询和确认。
   • 同时，也要妥善保管好不动产证，避免遗失或损坏。如果不动产证遗失或损坏，应及时向登记机构申请补发或换发。

总结来说，不动产证附记上有权籍调查审核专用章，并不影响不动产证的合法性和有效性。这个印章实际上是对不动产证上所载信息的一种官方认可和背书。如果你有任何关于不动产证的疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。