结论：开发商仅持有不动产权证而无需国有土地使用权证，并不必然意味着其开发行为完全合法，需结合具体法律规定和项目情况综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 不动产权证与国有土地使用权证的关系

• 不动产权证的法律性质：根据《民法典》及《不动产登记暂行条例》，不动产权证是权利人享有不动产物权的证明，涵盖土地、房屋等不动产。若开发商持有的是包含土地使用权的“大证”（即土地与房屋统一登记的不动产权证），则无需单独持有国有土地使用权证。
• 国有土地使用权证的独立性：在《物权法》实施前（2007年前），土地使用权与房屋所有权需分别登记，开发商需同时持有国有土地使用权证和房屋所有权证。但现行法律已实现“房地一体”登记，统一为不动产权证。因此，若不动产权证已明确记载土地使用权信息，则无需单独办理国有土地使用权证。

2. 合法性的核心判断标准

• 土地来源合法性：开发商需通过出让、划拨等合法方式取得土地使用权。若土地来源存在违法（如未缴纳土地出让金、未履行招拍挂程序），即使持有不动产权证，仍可能因程序违法被认定无效。
• 规划与建设合规性：除土地权属外，开发商还需取得建设工程规划许可证、施工许可证等，并符合规划要求。若项目存在超建、违建等问题，可能面临行政处罚或拆除风险。
• 登记内容真实性：不动产权证需真实反映土地使用权状况（如用途、期限、面积等）。若登记信息与实际不符（如虚假登记），可能影响权利效力。

3. 实务中的常见情形

• 合法情形：开发商通过合法出让取得土地，完成开发后申请统一登记为不动产权证，且登记内容完整、真实。此时无需单独持有国有土地使用权证，开发行为合法。
• 违法情形：
  1. 土地权属瑕疵：如土地系集体土地未依法征收即用于开发，或存在权属争议。
  2. 程序违法：如未取得建设工程规划许可证即开工建设。
  3. 登记瑕疵：如不动产权证记载的土地用途与实际用途不符（如工业用地用于商业开发）。

4. 法律风险与建议

• 对购房者的风险：若开发商仅持有不动产权证但存在上述违法情形，购房者可能面临房屋无法办理产权转移登记、被认定为违法建筑等风险。
• 建议：
  1. 核查登记信息：通过不动产登记中心查询开发商的不动产权证，确认土地使用权来源、用途、期限等是否合法。
  2. 审查开发手续：要求开发商提供建设工程规划许可证、施工许可证等文件，核实项目合规性。
  3. 咨询专业律师：若发现登记信息与宣传不符或存在程序瑕疵，应及时通过法律途径维权。

总结：不动产权证是开发商合法性的重要依据，但需结合土地来源、规划合规性等综合判断。若您对具体项目的合法性存疑，可直接向我咨询，我将结合项目细节提供专业分析。