针对您提出的“工程未结算，如何确定农民工工资在未结清限额支付”的问题，这确实是一个涉及法律关系和权益保障的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、案由确定与法律关系分析
在工程未结算的情况下，确定农民工工资的支付问题，首先需要明确农民工与用人单位之间的法律关系。这通常涉及以下几种情况：
劳务合同纠纷：
- 如果农民工与包工头、劳务分包方等签订了劳务合同，并明确约定了劳务内容、工资报酬及支付方式等条款，但工资未依约结算，那么这属于劳务合同纠纷。
- 在此情况下，农民工有权依据《中华人民共和国民法典》合同编的相关规定，要求合同对方按约定支付工资。
追索劳动报酬纠纷：
- 如果农民工与施工单位存在事实劳动关系，虽未签订书面劳动合同，但接受施工单位管理并提供劳动，且工资未结算，那么这属于追索劳动报酬纠纷。
- 农民工可以依据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》及相关司法解释，主张用人单位支付劳动报酬的义务。
建设工程施工合同纠纷（特殊转包、分包情形下）：
- 在复杂建设工程转包、分包情况下，如果因总承包方违法转包或分包导致实际施工人（包括农民工）工资无法结算，那么这可能涉及建设工程施工合同纠纷。
- 在此情况下，农民工可以依据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》等相关规定，寻求法律保护。
二、确定工资支付限额的考量因素
在工程未结算的情况下，确定农民工工资的支付限额，需要综合考虑以下因素：
已完成工程量与合同约定：
- 根据农民工已完成的工作量，结合劳务合同或劳动合同中的约定，计算应支付的工资数额。
工程进度与资金状况：
- 考虑工程的整体进度和资金状况，如果工程因资金问题导致结算延迟，应与用人单位协商确定合理的工资支付计划。
法律法规与政策要求：
- 遵守国家关于农民工工资支付的相关法律法规和政策要求，确保工资支付不低于当地最低工资标准，并按时足额支付。
三、建议的处理流程
协商与调解：
- 首先，农民工应尝试与用人单位进行协商，要求其按约定或实际情况支付工资。
- 如果协商无果，可以向企业所在地劳动争议调解委员会或其他具有调解职能的组织申请调解，寻求第三方协助解决争议。
申请劳动仲裁：
- 如果协商和调解均未能解决问题，农民工可以向当地劳动行政部门申请劳动仲裁。
- 申请时需提供相关证据材料，如劳务合同、工作记录、工资单等，以证明劳动关系的存在和用人单位的拖欠行为。
法律诉讼：
- 如果对劳动仲裁结果不满或劳动仲裁部门不予受理申请，农民工可以向人民法院提起诉讼。
- 在诉讼过程中，需要提供充分证据证明用人单位的拖欠工资行为，并请求法院依法判决用人单位支付工资及可能的赔偿。
四、额外建议
- 保留证据：农民工应妥善保留与用人单位之间的所有书面材料，如劳务合同、工作记录、工资单、转账记录等，以备不时之需。
- 及时咨询：在处理此类争议时，建议农民工及时咨询专业律师或法律援助机构，以获取更具体的法律建议和帮助。
综上所述，工程未结算时确定农民工工资的支付问题，需要明确法律关系、综合考虑多种因素，并遵循法定程序进行处理。希望以上解答能对您有所帮助。