核心结论：针对公司把工抵房登记给某员工，但业主和员工均未支付房款的情况，需要分情况处理，具体如下：

1. 从公司角度出发

   • 明确工抵房协议性质与约定：首先要查看公司与业主之间关于工抵房的具体协议内容。如果协议中明确约定了业主需在一定期限内支付房款，否则公司有权收回房屋或者采取其他救济措施，那么公司可以依据协议的约定，向业主发出催告通知，要求其在合理期限内支付房款。若业主在催告期满后仍未支付，公司可以按照协议约定解除合同，收回房屋，并要求业主承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
   • 审查与员工的登记关系：公司把工抵房登记给员工，需要明确这种登记行为的性质和目的。如果登记是基于某种内部安排，比如以员工名义暂时登记以便后续处理，而员工并未实际取得房屋所有权，那么公司可以与员工沟通，要求员工配合将房屋登记状态恢复原状或者按照公司指示进行处理。如果员工认为其基于某种原因有权保留房屋或者拒绝配合，公司需要审查内部的相关规定、协议或者决策程序，确定员工的权利义务范围，必要时可以通过内部纪律处分或者法律途径解决。
   • 考虑房屋的实际占有和使用情况：如果房屋已经被业主或者员工实际占有和使用，公司需要评估这种占有和使用的合法性。如果属于非法占有，公司可以要求占有人返还房屋，并可以通过报警或者诉讼等方式维护自己的权益。

2. 从员工角度出发

   • 了解自身权利义务：员工需要仔细审查公司与自己之间关于工抵房登记的相关文件和协议，明确自己在这其中的权利和义务。如果员工只是名义上的登记人，并未实际支付房款且没有取得房屋所有权的意图，那么员工应该及时与公司沟通，说明情况，避免因为房屋问题给自己带来不必要的法律风险，如被卷入公司与业主之间的纠纷或者承担不必要的债务。
   • 防范潜在法律风险：如果员工与工抵房登记存在某种利益关系，比如公司承诺给予员工一定好处而进行登记，员工需要评估这种行为的合法性和潜在风险。如果这种行为涉嫌违法违规，如逃避税收、违规操作房产等，员工可能会面临法律制裁，如罚款、没收违法所得等。员工应该及时停止相关行为，并配合公司或者相关部门进行调查和处理。

3. 从业主角度出发

   • 履行房款支付义务：如果业主与公司的工抵房协议是合法有效的，业主有义务按照协议约定支付房款。如果业主因为资金困难等原因暂时无法支付，应该及时与公司沟通，协商延期支付或者分期支付等方案，并签订书面协议明确双方的权利义务，避免因为逾期支付房款而承担违约责任。
   • 关注房屋登记情况：业主需要关注房屋的登记情况，确保房屋登记在自己名下或者符合协议约定的状态。如果发现房屋被登记在员工名下且存在异常情况，业主可以要求公司和员工说明情况，并协商解决。如果协商不成，业主可以通过法律途径维护自己的权益，如起诉要求确认房屋所有权或者要求公司和员工承担侵权责任等。

后续建议：在整个处理过程中，各方都应该保留好相关的证据，如协议、通知、沟通记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。如果纠纷无法通过协商解决，建议及时寻求法律帮助，通过诉讼或者仲裁等方式维护自己的合法权益。你可以将具体情况详细跟我说一说，以便我更精准地为你分析。