第三人申请再审和第三人撤销之诉是两种截然不同的法律程序，它们在制度目的、启动主体、启动事由、审理程序、审理结果、对生效裁判的影响以及管辖法院和提起时限等方面均存在显著差异。以下是对这两种法律程序的详细比较：
一、制度目的与本质
第三人撤销之诉：
- 目的：旨在保护因不可归责于自身的事由未能参加诉讼，且生效裁判损害其民事权益的第三人的合法权益。它本质上是一个新的诉讼，为第三人提供实体权益的第一次救济。
- 本质：基于新的事实提起，判决后可上诉，是一个独立的诉讼程序。
第三人申请再审：
- 目的：主要是为了纠正已经发生法律效力的裁判中存在的错误，确保司法裁判的正确性和公正性。它属于审判监督程序，是对已生效裁判的纠错机制。
- 本质：若是对二审案件再审，则不能上诉，是对原裁判的重新审理。
二、启动主体
第三人撤销之诉：
- 主体：只能由与案件处理结果有法律上利害关系的第三人启动，该第三人需满足特定条件，即因不可归责于本人的事由未参加诉讼，且有证据证明生效裁判损害其民事权益。
第三人申请再审：
- 主体：启动主体较为广泛，包括当事人、法定代理人、特定情况下的案外人（如对原判决、裁定、调解书确定的执行标的物主张权利，且无法通过新的诉讼解决争议的案外人），以及人民法院和人民检察院（依职权启动）。
三、启动事由
第三人撤销之诉：
- 事由：重点在于第三人因不能归责于自己的事由未参加诉讼，且生效裁判损害其民事权益。具体事由包括不知道诉讼存在、因客观原因无法参加诉讼等，同时需有证据证明裁判内容存在错误。
第三人申请再审：
- 事由：事由主要围绕原生效裁判存在错误，如事实认定错误、法律适用错误、违反法定程序、审判人员贪污受贿等。对于案外人申请再审，还需满足对执行标的享有实体权利等条件。
四、管辖法院与提起时限
第三人撤销之诉：
- 管辖法院：由作出生效裁判的人民法院专属管辖，不适用地域管辖、级别管辖的规定。
- 提起时限：第三人应当自知道或者应当知道其民事权益受到损害之日起6个月内提起诉讼，该期间为不变期间，不适用诉讼时效中止、中断、延长的规定。
第三人申请再审：
- 管辖法院：一般向作出原判决、裁定、调解书的人民法院申请，但特殊情况下可能根据审判监督程序规定由上级法院指令再审。
- 提起时限：当事人申请再审需在判决、裁定发生法律效力后一定期限内提出（通常为2年），但特定情形下可延长至知道或应当知道之日起6个月内。案外人申请再审一般在判决、裁定、调解书发生法律效力后，执行程序启动前提出；若在执行程序中，则应在执行程序终结前提出。对驳回执行异议裁定不服的，可自裁定送达之日起六个月内向原审法院申请再审。
五、审理程序与结果
第三人撤销之诉：
- 审理程序：法院受理后，需组成合议庭进行审理，围绕第三人的主张及原生效裁判的相关内容进行审查。
- 审理结果：如果第三人的主张成立，法院将撤销或改变原生效裁判中损害第三人民事权益的部分内容；否则，驳回其诉讼请求。
第三人申请再审：
- 审理程序：再审程序的启动需经过严格审查，符合条件的才会裁定再审。再审案件可能由原审法院审理，也可能由上级法院提审，同样需组成合议庭进行审理。
- 审理结果：如果原生效裁判确有错误，法院将依法予以纠正；如果经审理认为原裁判并无错误，则维持原裁判。再审判决是对原生效裁判的重新评判，具有终局性。
六、对生效裁判的影响
第三人撤销之诉：
- 影响：如果第三人的主张成立，法院将撤销或改变原生效裁判中损害第三人民事权益的部分内容，这对原生效裁判具有直接的法律效力变更作用。新判决仅对第三人及原诉讼当事人产生效力，不影响原判决在原诉讼当事人之间的既判力。
第三人申请再审：
- 影响：再审结果根据具体情况而定，如果原生效裁判确有错误，法院将依法纠正并作出新的裁判；如果原裁判无误，则维持原判，对原生效裁判的法律效力进行确认或修正。再审判决一旦作出，即具有终局性，除非有特别规定，否则不得再行申诉或申请再审。
总结与建议：
第三人撤销之诉与第三人申请再审在多个方面存在显著差异。在司法实践中，应根据具体情况选择适用的程序。如果您作为第三人，发现生效裁判损害了您的合法权益，且您因不可归责于自身的事由未能参加诉讼，那么您可以考虑提起第三人撤销之诉。如果您认为原生效裁判存在错误，且您符合申请再审的主体条件，那么您可以考虑申请再审。无论选择哪种程序，都建议您咨询专业律师，以确保您的合法权益得到有效维护。