要查询母亲在过户时是否合法处分了父亲的遗产份额，我们需要从几个关键方面进行详细的分析和确认。
首先，确认房屋的权属情况：
- 需要明确该房屋是否属于父母的夫妻共同财产。如果房屋是在父亲在世时与母亲共同购买的，那么它很可能属于夫妻共同财产。
- 确认父亲去世时，该房屋中属于他的部分是否作为遗产进行了分割。在父亲未留下遗嘱或遗赠抚养协议的情况下，这部分遗产应按照法定继承进行处理。
接下来，审查过户过程：
- 母亲在过户时，是否经过了所有法定继承人的同意或认可？如果母亲未经其他继承人同意，擅自将房屋过户给某一继承人（如儿子），这可能构成无权处分。
- 审查过户时是否签订了房屋买卖合同或其他相关协议，并确认这些协议是否合法有效。特别是要关注合同中是否涉及对父亲遗产份额的处分，以及是否得到了所有继承人的同意。
然后，考虑法律程序和证据：
- 如果母亲是通过公证继承或诉讼继承的方式办理过户的，那么这些程序本身就具有一定的法律效力和公信力。可以查阅相关的公证文书或法院判决书，以确认过户的合法性。
- 如果过户过程存在争议或疑问，可以收集相关证据（如房屋买卖合同、过户记录、继承人之间的沟通记录等），并咨询专业律师或法律机构，以获取更准确的法律意见。
最后，参考类似案例和法律规定：
- 可以参考类似遗产纠纷的案例，了解法院在处理类似情况时的判决依据和原则。例如，在父亲去世后，母亲无权单独处分其遗产份额，除非得到所有继承人的同意或认可。
- 同时，要熟悉相关的法律规定，如《继承法》中关于法定继承、遗嘱继承和遗产处分的规定，以确保自己的权益得到保障。
具体操作建议：
- 与母亲和其他继承人进行沟通，了解过户的具体情况和背景。
- 查阅房屋权属证明、过户记录和相关协议文件。
- 如果存在争议或疑问，咨询专业律师或法律机构以获取法律意见。
- 根据法律意见和实际情况，考虑是否需要通过法律途径解决争议。
综上所述，要查询母亲在过户时是否合法处分了父亲的遗产份额，需要从房屋权属、过户过程、法律程序和证据以及类似案例和法律规定等多个方面进行综合分析和确认。希望这些建议能对您有所帮助。