结论前置：商铺买卖合同已签字后，另加内容签补充协议，在满足特定条件时，是具有法律效力的。
一、补充协议具备法律效力的条件
当事人具有民事行为能力：
- 补充协议的签订双方，即商铺的买卖双方，必须均具备相应的民事行为能力。若一方为无民事行为能力人或限制民事行为能力人，且其签订行为未经法定代理人同意或追认，则该补充协议可能无效。例如，未成年人或精神病人未经法定代理人同意签订的补充协议，可能不具备法律效力。
真实意思表示：
- 补充协议的内容必须是双方当事人真实意思的表示，不得存在欺诈、胁迫、重大误解等违背当事人意愿的情况。若一方通过欺诈或胁迫手段使对方签订补充协议，该协议将被视为无效。例如，卖方以隐瞒商铺真实情况或威胁买方的方式签订补充协议，该协议可能不具备法律效力。
合法合规性：
- 补充协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得损害国家利益、社会公共利益以及他人合法权益。若补充协议中涉及非法交易或损害第三方利益的内容，该协议将不具备法律效力。例如，补充协议中约定逃避税收或侵犯他人知识产权的内容，将违反法律法规，不具备法律效力。
平等自愿原则：
- 补充协议应在双方平等、自愿的基础上协商达成，任何形式的强迫或不公平条款都将影响协议的合法性。若一方在签订补充协议时处于不利地位或受到不公平对待，该协议可能因违反平等自愿原则而无效。
二、补充协议与主合同的关系
补充性质：
- 补充协议通常被视为原商铺买卖合同的一部分，用于对原合同进行进一步的补充和完善。当补充协议与原合同中的条款发生冲突时，一般以补充协议为准，但原合同中明示不得变更的条款除外。例如，若原合同中明确约定了商铺的交付时间，而补充协议中对此进行了变更，且该变更不违反法律法规和公序良俗，则应以补充协议为准。
独立性：
- 尽管补充协议是对原合同的补充，但它也具有一定的独立性。即使原合同因某种原因被确认无效或被撤销，补充协议中独立存在的、合法有效的条款仍然可能保持其法律效力。例如，若原合同因卖方欺诈而被撤销，但补充协议中关于买方支付定金的条款是独立且合法的，则该条款可能仍然有效。
三、法律依据
- 《中华人民共和国民法典》：
- 第五百一十条：合同生效后，当事人可以就质量、价款或者报酬、履行地点等内容进行协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或交易习惯确定。
- 第四百六十五条：依法成立的合同受法律保护，并仅对当事人具有法律约束力。
四、实际操作建议
明确约定：
- 在签订补充协议时，双方应明确约定补充协议的内容、范围以及与原合同的关系，以避免未来产生纠纷。例如，可以明确约定补充协议是对原合同中哪些条款的补充或变更，以及补充协议与原合同冲突时的处理原则。
谨慎变更：
- 如果补充协议涉及对原合同重要条款的变更，双方应特别谨慎，并确保变更内容符合法律法规的规定，以免引发法律风险。例如，若变更商铺的交付时间或价款等关键条款，应充分考虑双方的利益和实际情况，确保变更的合理性和合法性。
保留证据：
- 在签订补充协议的过程中，双方应保留好相关证据，如协商记录、邮件往来、签字盖章的补充协议原件等，以备未来可能出现的纠纷时使用。
综上所述，商铺买卖合同已签字后另加内容签补充协议，在满足当事人具有民事行为能力、真实意思表示、合法合规性以及平等自愿原则等条件时，是具有法律效力的。在实际操作中，双方应严格遵守相关法律法规，确保补充协议的合法性和有效性，以维护自身的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。