借款合同中指定第三方收款人是有效的，但需满足一定条件并注意相关法律风险。以下从多个角度为你详细分析：

一、法律有效性

1. 合同自由原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是双方或多方当事人之间就权利义务达成的合意。在借款合同中，双方可以约定由第三方作为收款人，这是合同自由原则的体现。

2. 明确约定条款：为了确保指定第三方收款的有效性，借款合同中必须清晰、明确地写明由第三方收款的具体条款，包括第三方的身份信息、收款金额、收款时间、收款方式等。这些条款应具体、明确，以避免产生歧义。

3. 合同有效性条件：借款合同必须满足《民法典》第一百四十三条规定的条件，即行为人具有相应的民事行为能力，意思表示真实，不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。只有满足这些条件，借款合同才具有法律效力，指定第三方收款的条款也才有效。

二、第三方意愿与参与

1. 第三方认可：虽然借款合同双方可以约定由第三方收款，但最好取得第三方对收款义务的认可。这可以通过在合同中明确第三方同意收款的意思表示，或者由第三方单独出具同意收款的书面文件来实现。

2. 第三方拒绝收款：如果第三方拒绝收款，那么收款责任可能回归到借款合同约定的原收款方。因此，在约定第三方收款时，应充分考虑第三方的意愿和可靠性。

三、违约责任与权利保障

1. 违约责任：如果借款人（或指定的第三方）未按照约定向第三方收款人履行付款义务，或者履行付款义务不符合约定，借款人应当向出借人承担违约责任。这包括支付逾期利息、违约金等。

2. 权利保障：出借人在借款合同中约定第三方收款时，应确保自己的权利得到充分保障。例如，可以在合同中约定如果第三方未能按时、足额收款，出借人有权直接向借款人主张权利。

四、风险防范与安全评估

1. 诈骗风险：在涉及将款项支付给第三方的情况下，应特别警惕潜在的诈骗风险。特别是当第三方是陌生人或未经核实的情况下，应进行充分的调查和安全评估，以确定第三方的可信度和可靠性。

2. 追偿权利：即使约定了第三方收款，如果第三方未能按时、足额收款，出借人仍然有权依据借款合同向借款人主张权利。借款人在承担责任后，再根据其与第三方的关系进行追偿。

五、实例说明

例如，甲与乙签订借款合同，约定由丙作为收款人。在这种情况下，只要甲、乙、丙三方对此都明确同意并在合同中详细注明相关条款，且符合合同约定和法律规定，指定丙作为收款人就是可行的。但如果丙未能按约收款，乙仍有权向甲主张权利，甲在承担责任后可再向丙追偿。

总结与建议：借款合同中指定第三方收款人是有效的，但需要在合同中明确约定相关条款，并确保合同的有效性、安全性和第三方的意愿。同时，应警惕潜在的法律风险和诈骗风险。如果你在借款合同中遇到相关问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。