结论：在挪用资金罪案件中，公安机关能否扣押公司执行回来的财产，需根据财产的性质、来源以及与案件的关联性等因素综合判断。

分析说明：

1. 财产性质与来源：

   • 如果公司执行回来的财产属于被挪用资金的直接或间接返还，且这些资金原本就属于公司所有，那么公安机关在侦查过程中，为了查明案件事实、追缴赃款赃物，是有权对这些财产进行扣押的。
   • 如果公司执行回来的财产与挪用资金罪案件无直接关联，或者属于公司合法经营所得，那么公安机关通常无权扣押这些财产。

2. 与案件的关联性：

   • 公安机关扣押财产必须基于与案件的直接关联性。如果公司执行回来的财产能够证明犯罪嫌疑人的犯罪行为，或者这些财产是犯罪行为的直接或间接产物，那么公安机关有权扣押。
   • 如果财产与案件无直接关联，或者无法证明其与犯罪行为的联系，那么公安机关扣押这些财产可能缺乏法律依据。

3. 法律程序与权限：

   • 公安机关在扣押财产时，必须遵循严格的法律程序，包括出示搜查证、扣押决定书等法律文书，并告知被扣押人相关的权利和义务。
   • 扣押财产的范围和期限也必须符合法律规定，不得超出必要的限度。

特殊场景：

• 在某些复杂案件中，公司执行回来的财产可能涉及多个法律关系和利益主体。此时，公安机关在扣押财产前需要更加谨慎地评估财产的性质、来源以及与案件的关联性，以避免侵犯无辜第三方的合法权益。

行动建议：

• 公司角度：如果公司面临公安机关扣押财产的情况，应首先核实扣押财产的性质、来源以及与案件的关联性。如果认为扣押行为缺乏法律依据或侵犯了公司的合法权益，可以及时向公安机关提出异议，并寻求法律援助。
• 犯罪嫌疑人或被告人角度：如果犯罪嫌疑人或被告人认为公安机关扣押的财产与其犯罪行为无关或属于合法财产，可以在刑事诉讼过程中提出异议，并要求公安机关返还被扣押的财产。同时，也可以寻求律师的帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。

法律依据：

• 《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百四十一条规定：“在侦查活动中发现的可用以证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪的各种财物、文件，应当查封、扣押；与案件无关的财物、文件，不得查封、扣押。”这一条款为公安机关扣押财产提供了法律依据，同时也明确了扣押财产的范围和条件。

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