结论前置：
详细分析：
一、专门性规定优先
《林业行政处罚程序规定》是专门针对林业行政处罚制定的部门规章，它详细规定了林业行政处罚的适用范围、基本原则、管辖规定以及处罚程序等。这部规章的制定旨在规范林业行政处罚行为，保障和监督林业行政主管部门有效实施行政管理，同时保护公民、法人和其他组织的合法权益。因此，在处理林业行政处罚案件时，应优先适用《林业行政处罚程序规定》。
二、程序规定的具体内容
《林业行政处罚程序规定》明确了林业行政处罚的管辖原则、立案条件、调查取证方式、告知与听证程序、处罚决定程序以及执行程序等。例如，在管辖方面，该规定实行地域管辖为主、级别管辖为辅的原则，并明确了指定管辖和移送管辖的情形。在处罚程序方面，该规定区分了简易程序和一般程序，并详细规定了每种程序的适用条件和具体流程。
三、与《自然资源行政处罚办法》的关系
虽然《自然资源行政处罚办法》也是一部关于行政处罚的规章，但它主要规范的是自然资源领域的行政处罚行为。由于林业行政处罚具有其特殊性，如涉及林业资源的保护、利用和管理等，因此《自然资源行政处罚办法》的程序规定并不直接适用于林业行政处罚。当然，两部规章在某些原则和程序上可能存在相似性，如都强调公正、公开、及时的原则，都规定了调查取证、告知与听证等程序，但在具体程序、管辖、执行等方面仍需遵循《林业行政处罚程序规定》。
四、法律适用建议
在处理林业行政处罚案件时，建议相关当事人和林业行政主管部门严格遵守《林业行政处罚程序规定》的相关规定。如果案件涉及多个领域或存在法律适用上的疑问，可以及时咨询专业律师或相关法律机构，以确保案件的合法性和公正性。
总结与建议：
林业行政处罚应优先适用《林业行政处罚程序规定》的相关规定。这部规章为林业行政处罚提供了全面而详细的规范，确保了处罚的公正性、合法性和有效性。如果你在处理林业行政处罚案件时遇到任何法律问题或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。