在行政诉讼中，若原被告双方共同协商确定评估公司，且委托方为被告时，程序上仍然需要原被告双方共同参与并确认相关程序性事项，但具体参与程度和方式可能因案件情况和法院要求而有所不同。以下是对这一问题的详细分析：

一、行政诉讼中评估公司的选定程序

在行政诉讼中，当需要对某些专门性问题进行鉴定或评估时，通常会涉及到评估公司的选定。根据一般的法律原则和实践，评估公司的选定应当遵循公平、公正、公开的原则，以确保评估结果的客观性和准确性。若原被告双方能够协商一致确定评估公司，这通常是被鼓励的，因为它有助于减少争议和提高效率。

二、委托方为被告时的程序要求

1. 共同协商与确认：尽管委托方为被告，但评估公司的选定仍然需要原被告双方的共同协商和确认。这是因为评估结果将直接影响双方的权益，因此双方都有权参与并表达意见。
2. 法院的监督与审查：在选定评估公司后，法院通常会对选定过程进行监督和审查，以确保其符合法律程序和公平原则。如果法院认为选定过程存在不当之处，可能会要求重新选定或采取其他补救措施。
3. 程序性事项的确认：除了评估公司的选定外，原被告双方还需要就其他程序性事项进行确认，如评估的范围、时间、方式等。这些事项的确认同样需要双方的共同参与和协商。

三、原被告双方的具体参与方式

1. 协商会议：原被告双方可以召开协商会议，就评估公司的选定和其他程序性事项进行讨论和协商。在会议上，双方可以充分表达意见，并尝试达成一致意见。
2. 书面确认：在协商一致后，原被告双方可以签署书面确认文件，明确评估公司的选定结果和其他程序性事项。这份文件将作为后续诉讼程序的重要依据。
3. 法院参与：如果双方在协商过程中存在分歧或无法达成一致意见，可以请求法院介入并作出裁决。法院将根据法律程序和公平原则，对评估公司的选定和其他程序性事项进行裁决。

四、可能存在的特殊情况

在某些特殊情况下，如案件涉及国家秘密、商业秘密或个人隐私等，评估公司的选定和其他程序性事项可能需要采取更加严格的保密措施。在这种情况下，原被告双方的参与程度和方式可能会受到一定限制，但仍然需要确保双方的权益得到充分保障。

总结来说，在行政诉讼中，若原被告双方共同协商确定评估公司且委托方为被告时，程序上仍然需要原被告双方共同参与并确认相关程序性事项。这有助于确保评估结果的客观性和准确性，并维护双方的合法权益。如果您在行政诉讼中遇到相关问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。