是的，联合体串通投标时，联合体内的两个公司通常都会受到处罚。以下从不同角度为你详细分析：
法律背景与依据
在招投标活动中，串通投标是严重违反法律法规的行为，它破坏了市场的公平竞争环境，损害了其他投标人的合法权益。根据《中华人民共和国招标投标法》第五十三条的规定，投标人相互串通投标或者与招标人串通投标的，投标人以向招标人或者评标委员会成员行贿的手段谋取中标的，中标无效，处中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款，对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员处单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款；有违法所得的，并处没收违法所得；情节严重的，取消其一年至二年内参加依法必须进行招标的项目的投标资格并予以公告，直至由工商行政管理机关吊销营业执照；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
在联合体投标的情况下，联合体是由两个或两个以上的法人或者其他组织组成的一个临时性的组织，以一个投标人的身份共同投标。如果联合体内部成员之间存在串通投标的行为，那么整个联合体的投标都将被视为无效，且联合体内的各个成员都将承担相应的法律责任。
处罚对象与范围
联合体整体：由于联合体是以一个投标人的身份参与投标的，因此当联合体存在串通投标行为时，首先受到处罚的是联合体整体，其投标将被视为无效。
联合体内各公司：联合体内的各个公司作为联合体的成员，对于联合体的行为负有共同的责任。因此，当联合体存在串通投标行为时，联合体内的各个公司都将受到处罚，包括罚款、没收违法所得、取消投标资格等。在情节严重的情况下，还可能面临吊销营业执照等更严厉的处罚。
实际案例与启示
在实际操作中，已经有多起联合体串通投标被处罚的案例。这些案例表明，无论联合体的规模大小、成员数量多少，只要存在串通投标的行为，都将受到法律的严惩。因此，对于参与招投标活动的企业来说，必须严格遵守法律法规，秉持公平、公正、公开的原则参与竞争，避免任何形式的串通投标行为。
建议与措施
加强内部管理：企业应建立健全内部管理制度，加强对招投标活动的监督和管理，确保招投标活动的合法性和合规性。
提高法律意识：企业应加强对员工的法律培训和教育，提高员工的法律意识和风险意识，避免因为无知或疏忽而触犯法律。
积极配合调查：如果企业被怀疑存在串通投标行为，应积极配合相关部门的调查工作，如实提供相关证据和信息，以便尽快查明事实真相。
如果你或你的企业在招投标活动中遇到了相关法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。