收回扣不一定会使合作无效，其效力需视具体情况而定：

1. 如果收回扣行为严重违反法律法规的强制性规定，比如存在以回扣形式进行商业贿赂，违反了《反不正当竞争法》等规定，损害了国家利益、社会公共利益或者他人合法权益，那么合同可能被认定无效。因为这种行为破坏了公平竞争的市场秩序，法律对此持否定态度。

2. 若收回扣行为只是违反了一般的商业道德或行业规范，但未触及法律的强制性规定，合同不一定无效。在这种情况下，虽然行为可能不道德，但并不一定导致合同无效。

3. 对于收回扣的行为，受损方可以通过法律途径维护自身权益。例如，向法院或仲裁机构申请认定合同无效，同时可要求返还因该合同取得的财产，并赔偿损失。如果涉及刑事犯罪，司法机关将依法追究相关人员的刑事责任。

综上所述，收回扣是否会使合作无效，关键在于回扣行为是否违反了法律的强制性规定。因此，在签订合同时，双方应明确约定合作条款，避免涉及违法违规行为，以确保合同的合法有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。