核心结论：合同已签且款项已付，但营业执照办不下来，可先尝试协商解决，若协商不成，可根据合同约定和法律规定，通过要求解除合同、追究违约责任、要求赔偿损失等途径来维护自身权益。以下是具体分析：

1. 审查合同条款
   • 合同目的与约定：仔细查看合同中关于办理营业执照的具体条款，包括办理的时间节点、双方的权利义务、违约责任等。如果合同明确约定了对方在一定期限内必须办好营业执照，而对方未能履行，那么对方很可能构成违约。例如，合同约定“甲方应在合同签订后30日内为乙方办理好营业执照，否则每逾期一日，按照合同总金额的0.1%向乙方支付违约金”，若甲方未按时办理，就需按照此约定承担违约责任。
   • 免责条款：留意合同中是否存在免责条款，即哪些情况下对方可以免除办理营业执照的责任。比如，合同中约定因不可抗力或政府政策调整等不可预见、不可避免的原因导致营业执照无法办理，对方不承担责任。如果存在此类条款，需要判断当前情况是否符合免责条件。
2. 与对方协商
   • 沟通原因：首先与对方进行友好沟通，了解营业执照办不下来的具体原因。可能是资料准备不充分、审批流程出现问题或者存在其他客观障碍。例如，对方可能因为未及时提交完整的申请材料，导致审批部门不予受理。
   • 协商解决方案：根据了解到的原因，与对方协商解决方案。可以要求对方尽快采取措施解决问题，如补充资料、重新申请等；也可以协商延长办理期限，并明确新的期限和违约责任。如果对方表示无法继续履行合同，可以协商解除合同，并要求对方退还已支付的款项。
3. 追究违约责任
   • 要求继续履行：如果营业执照还有办理的可能，且你希望继续履行合同，可以要求对方按照合同约定继续办理营业执照，并承担因逾期办理给你造成的损失。例如，由于营业执照未及时办理，导致你无法正常开展业务，产生了租金、员工工资等损失，可以要求对方赔偿。
   • 解除合同：如果营业执照无法办理，或者对方明确表示无法继续履行合同，你可以要求解除合同。根据《中华人民共和国民法典》的规定，因一方违约导致合同目的无法实现的，另一方可以解除合同。合同解除后，对方应退还你已支付的款项，并赔偿你因此遭受的损失。
   • 赔偿损失：除了退还已支付的款项外，你还可以要求对方赔偿因违约给你造成的其他损失。损失赔偿的范围包括直接损失和间接损失，直接损失如你为办理营业执照而支付的费用，间接损失如因营业执照未办理而错过的商业机会所造成的损失等。但需要注意的是，间接损失的赔偿需要你有足够的证据证明其与对方的违约行为存在因果关系。
4. 寻求其他救济途径
   • 向相关部门投诉：如果对方在办理营业执照过程中存在违规行为，如提供虚假材料、贿赂审批人员等，你可以向工商行政管理部门等相关部门进行投诉，要求相关部门对其进行查处。
   • 申请仲裁或提起诉讼：如果与对方协商无果，你可以根据合同中的仲裁条款或者事后达成的仲裁协议，向仲裁机构申请仲裁；如果没有仲裁条款或仲裁协议，你可以向有管辖权的人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

在处理此类问题时，建议你保留好合同、付款凭证、沟通记录等相关证据，以便在需要时能够充分证明自己的主张。如果你在处理过程中遇到任何疑问或需要进一步的帮助，可以直接向我咨询。