结论：个体工商户1000平米火锅店月营业数据50万以上被定额季度税是否合法，需结合具体税收征收方式、定额依据及程序合法性综合判断，不能一概而论。以下从法律框架、合法性判断要点、风险提示三个角度展开分析：
一、法律框架：个体工商户税收征收的两种主要方式
根据《中华人民共和国税收征收管理法》及《个体工商户税收定期定额征收管理办法》，个体工商户的税收征收方式分为查账征收和定期定额征收两种：
- 查账征收：适用于财务制度健全、能准确核算收入成本的个体工商户，按实际经营情况申报纳税（如增值税、企业所得税/个人所得税、附加税等）。
- 定期定额征收：适用于经营规模小、财务核算不健全的个体工商户，由税务机关根据行业特点、地段、面积等因素核定应纳税额，按期缴纳（通常为季度或月度）。
关键点：若您的火锅店被税务机关认定为“定期定额征收”，则定额税收本身是合法的征收方式；但若实际营业额远高于定额，可能涉及定额调整或补税问题。
二、合法性判断要点：定额税收需满足“三合理”原则
即使采用定期定额征收，税务机关的核定也需符合以下条件，否则可能构成违法：
定额依据合理：
- 税务机关需根据《个体工商户税收定期定额征收管理办法》第六条规定的因素（如经营面积、地段、行业利润率等）综合核定定额。
- 1000平米的火锅店属于较大规模经营，若月营业额50万以上（即年营业额600万以上），税务机关需充分论证定额是否与实际经营能力匹配。若仅按面积或行业平均水平简单核定，可能缺乏合理性。
程序合法：
- 税务机关核定定额前，需履行送达《税务事项通知书》→纳税人陈述申辩→核定定额并公示→下达《核定定额通知书》等程序。
- 若您未收到相关通知，或未被告知定额依据及计算方式，可能存在程序违法。
动态调整机制：
- 根据《办法》第十六条，定期定额户的经营额连续3个月超过或低于税务机关核定定额20%的，需提请税务机关重新核定定额。
- 若您实际营业额持续高于定额，税务机关未主动调整或您未主动申报调整，可能面临补税及滞纳金风险。
三、风险提示：高营业额下定额税收的潜在风险
补税及滞纳金风险：
- 若税务机关通过查账或大数据比对（如发票开具金额、银行流水等）发现实际营业额远高于定额，可能要求您按实际经营情况补缴税款，并加收滞纳金（日万分之五）。
行政处罚风险：
- 若被认定“隐瞒经营额、逃避纳税”，可能面临罚款（税额50%至5倍）甚至刑事责任（如逃税罪，但需达到“数额较大且占应纳税额10%以上”标准）。
信用评级影响：
- 税务违规行为可能影响您的纳税信用等级，进而影响贷款、招投标等经营活动。
四、建议行动步骤
- 核实征收方式：向主管税务机关确认您的火锅店是否被认定为“定期定额征收”，并要求书面说明定额依据及计算方式。
- 自查经营数据：整理近1年的营业额、成本、发票等资料，评估实际经营情况与定额的匹配度。
- 主动沟通调整：若实际营业额持续高于定额，可主动向税务机关申请调整定额，避免后续风险。
- 法律救济途径：若认为定额违法，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
总结：定额税收本身是合法征收方式，但需满足“依据合理、程序合法、动态调整”三原则。若您的火锅店实际营业额远高于定额，建议尽快与税务机关沟通调整，避免法律风险。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。