结论：挪用资金罪立案后才超过三个月的资金是否算作犯罪，需结合具体情形判断，若立案时已满足“超过三个月未还”的条件，则后续资金状态不影响定罪；若立案时尚未满足，则需看立案后是否继续满足该条件。以下从不同角度详细分析：
一、挪用资金罪中“三个月未还”的认定标准
根据《中华人民共和国刑法》第二百七十二条的规定，挪用资金罪的成立需满足“数额较大、超过三个月未还”的条件。这里的“三个月”是指从挪用资金之日起至案发时或归还之日止，时间跨度超过三个月。关键在于挪用行为发生时至立案时是否已超过三个月未还，而非立案后才超过三个月。
- 起算点：挪用资金行为的起算点，是资金实际被挪出单位账户或脱离单位控制的日期。这通常发生在资金的占有、控制权发生实际转移之时。
- 计算方式：“三个月”的计算是按照自然日（日历日）来进行的，节假日和休息日均包含在内，计算不会因这些因素而中断。
- 截止点：截止点是资金被全额归还到单位账户或重新恢复单位控制的日期。只有当所有被挪用的资金都已被归还，计算才停止。部分归还的情况下，对于剩余未归还的资金，计算时间不会中断，而是持续进行直至全部归还。
二、立案后才超过三个月的资金是否算作犯罪
立案时已满足“超过三个月未还”的条件：
- 如果在立案时，挪用资金的行为已经满足“数额较大、超过三个月未还”的条件，那么即使立案后资金继续未还，也不影响定罪。因为定罪的关键在于挪用行为发生时至立案时是否已满足犯罪构成要件。
立案时尚未满足“超过三个月未还”的条件：
- 如果在立案时，挪用资金的行为尚未满足“超过三个月未还”的条件（例如，挪用资金仅两个月），但立案后继续未还直至超过三个月，那么是否构成犯罪需看具体情况。
- 在这种情况下，如果挪用资金的行为在立案后继续持续，且最终满足“超过三个月未还”的条件，理论上可以构成挪用资金罪。但实践中，由于立案时证据已经固定，后续是否继续满足条件可能影响量刑而非定罪。
三、特殊情况下的法律适用
- 挪用资金进行营利活动或非法活动：如果挪用人在挪用资金后进行了营利活动或非法活动，即使未满三个月，也可能构成挪用资金罪。此时，“三个月”不再是判断的唯一标准。
- 部分归还的情况：如果挪用人在挪用资金后部分归还了资金，但对于剩余未归还的部分，如果时间跨度超过三个月，仍可能构成挪用资金罪。
四、法律建议
- 及时归还资金：如果发现自己有挪用资金的行为，应尽快归还资金，以避免构成犯罪。
- 咨询专业律师：虽然这里我作为黄兴同律师已经给出了详细的解释，但每个案件的具体情况都有所不同。如果你或你身边的人涉及此类问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供更具体的法律建议。
- 提高法律意识：作为公司、企业或其他单位的工作人员，应严格遵守财经纪律和法律法规，不利用职务之便挪用单位资金。
总结：挪用资金罪立案后才超过三个月的资金是否算作犯罪，需结合具体情形判断。关键在于挪用行为发生时至立案时是否已满足“超过三个月未还”的条件。如果涉及此类问题，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。