挪用资金罪超过三个月归还的，仍可能追究刑事责任，但具体是否追究需结合多种因素综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定与构成要件
根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，挪用资金罪是指公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或者借贷给他人，数额较大、超过三个月未还的，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动的，或者进行非法活动的行为。这里的关键构成要件包括：
- 主体要件：必须是公司、企业或者其他单位的工作人员。
- 行为要件：利用职务上的便利，挪用本单位资金。
- 数额与时间要件：数额较大，且超过三个月未还（或虽未超过三个月，但数额较大且用于营利活动或非法活动）。
二、超过三个月归还的影响
仍可能构成犯罪：
- 即便资金在三个月后归还，若数额达到当地规定的“数额较大”标准，仍可能构成挪用资金罪。因为此时已经满足了挪用资金罪的时间要件（超过三个月未还）和数额要件。
量刑可能减轻：
- 如果在案发前全部归还了挪用资金，且情节显著轻微危害不大，根据相关法律规定和司法实践，可能不认为是犯罪，或者量刑时予以从轻、减轻处罚。但这并不意味着完全免除刑事责任，而是需要综合全案情节进行判断。
三、综合判断因素
在判断是否追究刑事责任时，除了考虑时间和数额因素外，还需要综合考虑以下因素：
挪用资金的用途：
- 如果挪用资金用于非法活动，无论数额多少和时间长短，都可能被追究刑事责任。
- 如果挪用资金用于营利活动，只要数额较大，即使未超过三个月，也可能构成犯罪。
归还情况：
- 如前所述，案发前全部归还且情节显著轻微的，可能不认为是犯罪或量刑从轻。
- 但如果只是部分归还或未归还，且数额较大、超过三个月未还，则更可能被追究刑事责任。
其他情节：
- 如挪用资金的次数、是否造成严重后果、行为人的主观恶性等，也可能影响刑事责任的追究。
四、建议与风险提示
及时归还：
- 如果发现自己有挪用资金的行为，应尽快归还，以减轻可能的法律后果。
咨询专业律师：
- 由于挪用资金罪的认定和量刑涉及多个复杂因素，建议行为人及时咨询专业律师，以便更准确地了解自己的法律风险和应对策略。不过，作为齐鹏律师，我可以直接为你提供这方面的法律咨询。
遵守法律法规：
- 最根本的是要遵守法律法规，不要利用职务之便挪用单位资金，以免触犯法律。
如有任何关于挪用资金罪或其他刑事法律问题的疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供更详细、更专业的法律建议。