结论：在和上游公司有业务纠纷，但上游公司的业务联系人不是法人也不是股东的情况下，您仍然可以起诉上游公司，关键在于确定合适的被告主体并收集充分的证据。

详细分析：

1. 确定被告主体：

   • 在民事诉讼中，被告通常是与原告发生民事法律关系并产生纠纷的对方主体。在此情况下，尽管业务联系人不是法人也不是股东，但您是与上游公司（即该业务联系人所在的公司）发生的业务纠纷，因此，上游公司应当作为被告。
   • 如果业务联系人的行为构成了表见代理（即他让您有理由相信其有权代表上游公司行事），或者上游公司事后追认了业务联系人的行为，那么您起诉上游公司更是毫无障碍。

2. 收集证据：

   • 合同证据：如果您与上游公司签订了书面合同，那么合同是证明双方权利义务关系的重要证据。请确保您保存了合同的原件或复印件，并能够提供给法院。
   • 交易记录：包括订单、发货单、收货单、付款凭证等，这些证据能够证明您与上游公司之间的实际交易情况。
   • 沟通记录：与业务联系人的邮件、短信、微信等沟通记录，这些记录可能包含关于交易细节、纠纷原因等重要信息。
   • 证人证言：如果有其他知情人士（如您的员工、其他供应商等）能够证明您与上游公司之间的交易情况或纠纷原因，他们的证言也可能对案件有帮助。

3. 起诉流程：

   • 撰写起诉状：起诉状应当明确列明原告、被告的基本信息，诉讼请求（即您希望法院判决上游公司做什么），以及事实和理由（即您与上游公司之间的交易情况、纠纷原因等）。
   • 提交法院：将起诉状及相关证据提交给有管辖权的法院。通常，您可以选择上游公司所在地或合同履行地的法院进行起诉。
   • 等待法院受理：法院在收到起诉状后，会进行审查，如果认为符合起诉条件，会予以受理，并通知您缴纳诉讼费。
   • 参与庭审：在法院受理案件后，会安排庭审。您需要按照法院的通知参与庭审，并陈述自己的诉讼请求和事实理由。

4. 可能遇到的法律问题及应对：

   • 业务联系人的行为是否构成表见代理：如果上游公司否认业务联系人的代理权，您需要证明业务联系人的行为构成了表见代理。这通常需要您提供证据证明您有理由相信业务联系人有权代表上游公司行事。
   • 证据的充分性：在诉讼中，证据的充分性至关重要。如果您的证据不足以证明您的诉讼请求，法院可能会驳回您的起诉或判决您败诉。因此，在起诉前，请务必确保您收集了充分的证据。

建议：

• 在起诉前，尽量与上游公司进行协商，看是否能够通过和解的方式解决纠纷。这不仅可以节省时间和精力，还可以避免不必要的法律费用。
• 如果协商无果，再考虑起诉。在起诉前，建议您咨询专业律师（当然，我就是您身边的法律顾问，有问题可以直接向我咨询），以确保您的起诉状撰写得当，证据收集充分，从而提高胜诉的几率。