若您已经涉及虚开发票且成为100%股权的法人，可能面临行政处罚、刑事责任以及公司治理层面的多重风险，需立即采取补救措施并配合调查。以下从法律责任、补救措施、公司治理三个维度展开分析：

一、法律责任层面：可能同时触犯行政与刑事责任

1. 行政责任
   根据《发票管理办法》第三十五条，虚开发票（包括为他人、为自己、让他人为自己或介绍他人虚开）的，由税务机关没收违法所得，并处5万元以上50万元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。即使您作为法人未直接参与虚开行为，若公司被认定存在虚开事实，您作为法定代表人仍可能因“未履行忠实勤勉义务”被税务机关处罚。

2. 刑事责任
   若虚开发票行为符合《刑法》第二百零五条之一“虚开发票罪”构成要件（即虚开税款数额1万元以上或致使国家税款被骗取5000元以上），可能面临二年以下有期徒刑、拘役或管制，并处罚金；情节特别严重的（如虚开税款数额巨大或造成国家税款重大损失），处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
   特别提醒：若虚开行为同时涉及增值税专用发票，可能构成更严重的“虚开增值税专用发票罪”，最高可处无期徒刑。

二、补救措施层面：主动配合调查是关键

1. 立即停止虚开行为
   若虚开发票行为仍在持续，需第一时间终止，并封存相关账目、合同、沟通记录等证据，避免证据灭失。

2. 配合税务/司法调查
   主动向税务机关或公安机关说明情况，提交书面陈述材料，重点强调：

   • 您作为法人的不知情情况（如被他人蒙骗、未参与实际经营等）；
     
   • 公司财务制度存在的漏洞（如印章管理、发票审核流程缺陷）；
     
   • 积极整改的意愿（如补缴税款、缴纳罚款、完善内控等）。
     法律依据：根据《刑事诉讼法》第十五条，自首、立功或认罪认罚可从宽处理。

3. 补缴税款与罚款
   若已造成国家税款损失，需尽快补缴税款及滞纳金，并主动缴纳行政罚款，以降低刑事风险。根据《刑法》第二百零一条，逃税后经税务机关下达追缴通知后补缴税款、缴纳滞纳金且接受行政处罚的，不予追究刑事责任（但五年内因逃避缴纳税款受过刑事处罚或被税务机关给予二次以上行政处罚的除外）。

三、公司治理层面：需防范连带风险

1. 审查股权结构与控制权
   作为100%股权的法人，您需确认：

   • 股权是否实际由您控制？若存在“名义股东”或“股权代持”情况，需立即固定证据（如代持协议、资金流水），避免被认定为实际控制人；
     
   • 公司是否存在其他股东或高管参与虚开行为？若存在，需收集其责任证据，避免被“牵连”。

2. 完善公司治理制度
   立即修订公司章程、财务制度，明确：

   • 发票开具、审核、保管的流程与责任人；
     
   • 印章使用需双人审批并留存记录；
     
   • 定期聘请第三方审计机构进行财务合规审查。
     目的：通过制度完善证明您已履行法人职责，降低“未尽勤勉义务”的认定风险。

3. 考虑股权变更或法人变更
   若虚开行为风险极高，可考虑将股权转让给无关联第三方，或变更法人代表（需注意：变更法人不代表免除原法人责任，但可降低后续经营风险）。

最后提醒：虚开发票案件往往涉及税务、公安、检察院多部门联合调查，处理周期长、风险高。建议您尽快整理公司账目、合同、沟通记录等材料，并携带身份证、营业执照等证件，与我详细沟通案件细节（如虚开金额、参与人员、是否已立案等），以便制定更精准的应对方案。