针对您提出的“虚开100万的发票怎么处理”这一问题，这是一个涉及严重法律后果的行为，必须给予高度重视。以下是我为您详细梳理的处理方式及法律后果：

一、法律后果概述

虚开发票100万，不仅将面临税务机关的严厉行政处罚，还可能触犯刑法，承担刑事责任。特别是当这种行为涉及单位时，单位及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员都将受到法律的制裁。此外，这种行为还可能被税务机关向社会公告，对个人或单位的声誉和信用造成极大损害。

二、行政处罚措施

根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，对于虚开发票的行为，税务机关将采取以下措施：

1. 没收违法所得：这是税务机关对虚开发票行为的基本处罚之一，旨在剥夺违法者的非法收益。

2. 罚款：由于虚开金额达到100万，远超法律规定的标准，因此将并处5万元以上50万元以下的罚款。这一罚款幅度较大，具体数额将根据违法情节的严重程度来确定。

三、刑事责任追究

虚开发票行为还可能触犯刑法，具体分为以下两种情况：

1. 虚开增值税专用发票、用于骗取出口退税、抵扣税款发票罪：

   • 如果虚开的是增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票，且虚开的税款数额在五十万元以上，将被认定为“数额较大”。
   • 根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条，此类行为将面临三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金；若数额巨大或有其他特别严重情节，则将面临十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。

2. 虚开发票罪：

   • 如果虚开的是除上述之外的其他发票，且情节严重的（如虚开发票一百份以上或虚开金额累计在四十万元以上），则构成虚开发票罪。
   • 依据《中华人民共和国刑法》第二百零五条之一，此类行为将面临二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；若情节特别严重，则将面临二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。

四、单位犯罪的处理

如果虚开发票行为是单位所为，那么单位将被判处罚金。同时，对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员，也将依照前述刑法规定进行处罚。这意味着，单位犯罪不仅会影响单位本身，还会波及到相关责任人员。

五、其他可能的后果

除了行政处罚和刑事责任外，虚开发票行为还可能面临其他后果。根据《中华人民共和国发票管理办法》，对违反发票管理规定2次以上或情节严重的单位和个人，税务机关有权向社会公告。这将严重损害单位和个人的声誉及信用，对其未来的经营和发展造成不利影响。

六、处理建议

面对虚开发票100万的严重问题，我建议您采取以下措施：

1. 立即咨询专业律师或税务机构：全面了解法律风险及应对措施，确保自己的权益得到最大程度的保护。

2. 积极配合相关部门的调查和处理工作：如实说明情况并提供相关证据材料，以便相关部门能够准确判断违法情节的严重程度，并作出公正的处理决定。

3. 加强内部管理：严格遵守税收法规，建立健全的发票管理制度，防止类似事件再次发生。

综上所述，虚开发票100万将带来极其严重的法律后果。因此，无论是个人还是单位，都应严格遵守相关法律法规和税收政策规定，确保合法合规经营，避免触碰法律红线。