针对您提出的“虚开发票九百万怎么处理”这一问题，我可以明确地告诉您，虚开发票是一种严重的违法犯罪行为，特别是当虚开金额达到九百万这样的大额时，将面临极为严厉的法律后果。以下是我为您详细梳理的处理流程和相关法律责任：

一、行政责任层面

根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，虚开发票是明确禁止的。对于您提到的九百万虚开发票行为，税务机关将首先进行行政查处。这包括但不限于：

1. 没收违法所得：税务机关会依法没收因虚开发票而获得的全部非法收入。

2. 高额罚款：由于虚开金额巨大，税务机关将并处五十万元以下的罚款上限（根据规定，虚开金额超过1万元的，罚款范围为5万元以上50万元以下），但具体数额会结合虚开情节的严重程度、纳税人的配合态度等因素综合判定，不过在此类大额虚开案件中，罚款往往接近或达到上限。

二、刑事责任层面

更为严重的是，九百万的虚开发票金额已经远远超出了刑事立案的标准，将触犯《中华人民共和国刑法》的相关规定，具体可能涉及以下罪名：

1. 虚开增值税专用发票、用于骗取出口退税、抵扣税款发票罪：

   • 根据《刑法》第二百零五条，此罪名下的刑罚极为严厉，包括有期徒刑、无期徒刑，并处没收财产，具体刑期和罚金数额将根据虚开的税款数额、情节严重程度等因素综合判断。在九百万这样的大额虚开案件中，犯罪嫌疑人很可能面临长期的有期徒刑甚至无期徒刑。

2. 若虚开的是非增值税专用发票：

   • 则可能触犯《刑法》第二百零五条之一的虚开发票罪，同样将受到有期徒刑、拘役或者管制以及罚金等刑事处罚。对于情节特别严重的，刑罚也会相应加重。

三、建议与总结

1. 立即停止违法行为：如果您或您所知的人涉及此类行为，应立即停止一切虚开发票的活动，避免进一步加重法律后果。

2. 积极配合调查：在税务机关或司法机关介入调查时，应如实陈述事实，积极配合调查工作，这有助于在后续处理中争取一定的宽大处理。

3. 寻求专业法律帮助：鉴于此类案件的复杂性和严重性，建议您尽快咨询专业律师的意见，以便更好地了解自己的法律权利和义务，以及可能面临的法律后果。

4. 严格遵守法律法规：最后，我要强调的是，遵守税收法规和发票管理规定是每个纳税人的基本义务。只有确保开具的发票真实、合法、有效，才能避免陷入法律风险和经济损失的困境。

综上所述，虚开发票九百万将面临极为严厉的行政和刑事处罚。因此，我强烈建议您或相关人员务必严格遵守法律法规，避免此类行为的发生。如果不幸涉及此类问题，请立即寻求专业法律帮助并积极配合调查处理工作。