结论：和公司签订赔偿协议后，若公司倒闭，代理人是否承担责任需视具体情况而定，一般情况下代理人不直接承担公司债务，但存在例外情形。以下从不同角度进行分析：
一、一般原则：代理人不直接承担公司债务
代理关系的本质：
- 代理是指代理人以被代理人（公司）的名义，在代理权限内与第三人实施民事法律行为，其法律后果直接由被代理人承受的法律制度。
- 在您与公司签订赔偿协议的场景中，若代理人是在公司授权范围内行事，且协议明确约定了公司为赔偿义务主体，那么代理人通常不直接承担赔偿责任。
公司独立法人地位：
- 公司作为独立法人，拥有独立的财产权，能够以其全部财产对公司的债务承担责任。
- 当公司倒闭时，其债务应由公司财产进行清偿，代理人个人财产一般不用于清偿公司债务。
二、例外情形：代理人可能承担责任的几种情况
代理人超越代理权限：
- 若代理人超越公司授权范围，以公司名义与您签订赔偿协议，且您对此不知情或不应知情，那么代理人可能构成无权代理或表见代理。
- 在无权代理情况下，若公司拒绝追认，代理人需自行承担赔偿责任；在表见代理情况下，虽公司可能需承担责任，但代理人也可能因过错而承担相应责任。
代理人与公司财产混同：
- 若代理人与公司财产混同，难以区分个人财产与公司财产，如代理人将公司资金用于个人消费或投资等，可能构成财产混同。
- 在财产混同情况下，代理人可能需对公司债务承担连带责任，因为其个人财产与公司财产已无法区分，损害了债权人的利益。
代理人存在故意或重大过失：
- 若代理人在签订赔偿协议过程中存在故意或重大过失，如故意隐瞒公司真实财务状况、误导您签订不公平协议等，那么代理人可能需对其过错行为承担责任。
- 这种责任可能基于侵权责任或违约责任等法律基础，具体需根据案件事实和法律规定进行判断。
三、建议与措施
审查代理权限：
- 在签订赔偿协议前，务必审查代理人的代理权限，确保其是在公司授权范围内行事。
- 可要求代理人出示公司授权委托书或相关证明文件，以确认其代理资格。
明确赔偿义务主体：
- 在赔偿协议中明确约定赔偿义务主体为公司，并注明代理人的代理身份和权限。
- 避免使用模糊或歧义性的表述，以免引发后续纠纷。
关注公司财务状况：
- 在签订赔偿协议前，尽可能了解公司的财务状况和偿债能力。
- 若公司已出现财务危机或破产迹象，需谨慎考虑签订赔偿协议的风险。
寻求法律帮助：
- 若您对赔偿协议的内容或代理人的行为存在疑虑，建议及时咨询专业律师。
- 律师可以为您提供法律意见和风险评估，帮助您制定合理的应对策略。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。