若养殖水库在合法养殖期间被纳入禁捕区域，养殖户可采取以下措施来维护自身权益：

1. 核查相关政策与文件：

   • 首先，养殖户应详细核查当地政府或相关部门发布的关于禁捕区域的公告、文件或政策，了解禁捕的具体范围、时间、原因以及是否有相应的补偿措施。
   • 确认自己的养殖水库是否确实被纳入禁捕区域，以及禁捕政策对自己的养殖活动产生的具体影响。

2. 评估养殖现状与损失：

   • 对养殖水库的现状进行全面评估，包括养殖品种、数量、生长阶段等，以估算因禁捕政策可能导致的经济损失。
   • 收集相关证据，如养殖记录、销售合同、投入成本等，以便在后续协商或诉讼中证明自己的损失。

3. 与政府部门沟通协商：

   • 主动与发布禁捕政策的政府部门进行沟通，表达自己的关切和诉求，寻求合理的解决方案。
   • 根据政策规定，了解是否有补偿机制或过渡期安排，以及如何申请补偿或享受相关政策优惠。

4. 考虑法律途径：

   • 如果与政府部门的沟通协商未能达成满意的结果，养殖户可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
   • 可以咨询专业律师（即我本人，擅长多领域法律实务），了解自己的法律权利和可能的诉讼策略，包括提起行政诉讼或民事诉讼等。
   • 在诉讼过程中，需要提供充分的证据来证明自己的损失和政府部门的违法行为或不当决策。

5. 关注政策动态与调整养殖计划：

   • 密切关注相关政策的动态变化，了解是否有新的政策出台或原有政策进行调整。
   • 根据政策变化和市场需求，及时调整养殖计划，探索新的养殖模式或转型其他产业，以降低政策风险对自身经营的影响。