结论：二次协商多还的款项能否退款及如何退，需根据具体情况判断，主要包括协商内容是否构成新的合同、对方是否同意退款、是否存在重大误解或显失公平等情形。以下从不同角度详细分析：
一、协商内容是否构成新的合同
若二次协商构成新的合同：
- 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是双方意思表示一致的协议。如果二次协商时，双方就还款金额、还款方式等达成了新的合意，并形成了书面或口头的合同，那么该合同对双方均具有约束力。
- 退款可能性：在此情况下，如果多还的款项并非基于新合同的约定，而是由于误解或计算错误等原因，那么退款的可能性取决于对方是否同意。如果对方同意，可以协商退款；如果对方不同意，且新合同中并未约定退款条款，那么退款可能面临困难。
- 建议：尝试与对方沟通，说明多还款项的原因，并协商退款事宜。如果沟通无果，可以考虑通过法律途径解决，但需注意收集相关证据，如转账记录、协商记录等。
若二次协商未构成新的合同：
- 法律背景：如果二次协商只是双方对原合同履行情况的沟通，并未形成新的合意或合同，那么多还的款项可能被视为对原合同的超额履行。
- 退款可能性：在此情况下，根据《中华人民共和国民法典》中关于不当得利的规定，受损失的人有权请求得利人返还取得的利益。因此，如果多还的款项确实属于不当得利，那么有权要求对方退款。
- 建议：首先与对方沟通，说明多还款项的情况，并要求对方退款。如果对方拒绝，可以收集相关证据，如转账记录、原合同、协商记录等，向法院提起诉讼，要求对方返还不当得利。
二、对方是否同意退款
- 法律背景：无论二次协商是否构成新的合同，对方是否同意退款都是影响退款结果的关键因素。
- 退款可能性：如果对方同意退款，那么问题相对简单，只需按照双方协商的退款方式和时间进行退款即可。如果对方不同意退款，则需要根据上述法律背景和具体情况，考虑通过法律途径解决。
- 建议：在沟通退款事宜时，尽量保持冷静和理性，避免情绪化。同时，可以尝试提出合理的退款方案，如分期退款、扣除一定手续费后退款等，以增加对方同意退款的可能性。
三、是否存在重大误解或显失公平等情形
- 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，因重大误解订立的合同或者一方利用对方处于危困状态、缺乏判断能力等情形，致使民事法律行为成立时显失公平的，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
- 退款可能性：如果二次协商时存在重大误解或显失公平等情形，导致多还了款项，那么有权请求撤销相关协议或合同，并要求对方退款。
- 建议：如果认为二次协商时存在重大误解或显失公平等情形，应及时收集相关证据，如协商记录、证人证言等，并向法院提起诉讼或申请仲裁机构仲裁，请求撤销相关协议或合同并退款。
后续行动建议：
- 收集证据：无论选择哪种途径解决退款问题，都需要收集相关证据来支持自己的主张。证据可以包括转账记录、原合同、协商记录、证人证言等。
- 咨询专业律师：虽然我在这里提供了一些法律建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在采取行动之前，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见。
- 保持沟通：在解决退款问题的过程中，保持与对方的沟通是非常重要的。通过沟通可以了解对方的想法和态度，并尝试达成双方都能接受的解决方案。
如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。