既有违纪行为又有犯罪行为，一般不会合并处理，而是分别依据相应的纪律规定和法律规定进行处罚。以下从不同角度进行详细分析：

一、违纪行为与犯罪行为的性质差异

1. 违纪行为：通常指的是违反组织内部规章制度、行业规范或职业道德的行为。这类行为主要受到组织内部纪律处分，如警告、记过、降职、开除等，其目的在于维护组织的秩序和纪律。

2. 犯罪行为：则是指违反国家法律法规，具有社会危害性，应受刑罚处罚的行为。犯罪行为会受到国家司法机关的追究，可能面临有期徒刑、无期徒刑、罚金、没收财产等刑罚。

二、处理方式的独立性

1. 纪律处分：对于违纪行为，组织或单位会根据其内部规章制度进行相应的纪律处分。这种处分是组织内部的行政行为，不涉及司法程序。

2. 刑事处罚：对于犯罪行为，司法机关会依法进行侦查、起诉、审判等司法程序，最终根据犯罪情节和法律规定作出刑罚判决。

三、合并处理的可能性与限制

1. 一般情况不合并：由于违纪行为和犯罪行为在性质、处理方式和法律后果上存在显著差异，因此一般不会合并处理。组织或单位在处理违纪行为时，不会考虑犯罪行为的法律后果；同样，司法机关在处理犯罪行为时，也不会直接涉及违纪行为的纪律处分。

2. 特殊情况下的关联：在某些特殊情况下，违纪行为和犯罪行为可能存在一定的关联。例如，某些犯罪行为可能同时违反了组织的规章制度，此时组织或单位可能会在司法机关处理犯罪行为的同时，根据内部规章制度对违纪行为进行纪律处分。但这种处分仍然是独立的，不替代或影响司法机关对犯罪行为的处理。

四、法律建议

1. 明确行为性质：对于既有违纪行为又有犯罪行为的情况，首先应明确每种行为的性质和处理方式。违纪行为应依据组织内部规章制度进行处理；犯罪行为则应依法接受司法机关的追究。

2. 积极配合调查：在面对违纪和犯罪行为的调查时，应积极配合相关部门的工作，如实陈述事实，提供证据材料。这有助于维护自身权益，也有助于问题的妥善解决。

3. 寻求专业帮助：如果涉及复杂的法律问题或面临严重的法律后果，建议及时咨询专业律师。律师能够提供专业的法律意见和帮助，确保你的权益得到充分保障。

总结来说，既有违纪行为又有犯罪行为时，一般不会合并处理。而是应分别依据相应的纪律规定和法律规定进行处罚。在处理过程中，应明确行为性质、积极配合调查，并在必要时寻求专业帮助。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。