在单位购买的国有土地有协议但未过户，协议的效力需分情况讨论：

1. 协议本身的效力
   根据《民法典》第215条，未办理物权登记不影响合同效力。若土地买卖协议系双方真实意思表示，内容不违反法律、行政法规的强制性规定（如未违反土地用途管制、未损害国家利益等），且不存在欺诈、胁迫、恶意串通等情形，协议本身有效，双方需按约定履行义务（如支付价款、交付土地）。

2. 未过户的法律后果
   未办理过户登记仅导致物权未变动，即买方尚未取得土地使用权。根据《民法典》第209条，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记才发生效力。因此：

   • 买方仅享有合同债权（可要求卖方配合过户），但未取得物权；
     
   • 若卖方将土地再次转让或抵押给第三人，且第三人已办理过户登记，买方可能面临无法取得土地的风险（需通过违约赔偿救济）；
     
   • 若土地被查封、征收或涉及其他纠纷，买方可能因未过户而无法主张优先权利。

3. 风险提示与建议

   • 风险点：未过户可能导致买方权益落空，尤其在卖方信用风险较高或土地价值大幅变动时；
     
   • 建议：
     
     1. 立即要求卖方配合办理过户登记，完善物权公示；
        
     2. 若无法过户，可在协议中约定高额违约金或抵押担保，降低卖方违约风险；
        
     3. 保留付款凭证、协议原件等证据，以备后续维权；
        
     4. 关注土地权属状态，避免因卖方债务导致土地被执行。

总结：协议有效，但未过户仅产生债权效力，买方需通过过户登记或补充担保措施巩固权利。如有具体纠纷，可进一步提供协议细节，我将结合条款分析风险点。