核心结论：针对特殊工种档案中存在不在岗人员的情况，需根据具体原因和法律规定，采取核实档案信息、补正材料、申请更正或通过法律途径解决等措施。以下是具体分析和建议：

1. 核实档案信息与不在岗原因
   首先需确认档案中“不在岗”记录的具体内容（如时间、原因）是否与实际情况一致。若因单位管理疏漏导致记录错误（如误将调岗、休假人员标记为不在岗），应要求单位出具书面说明，明确实际在岗情况及原因。若因员工本人原因（如长期病假、停薪留职等）导致不在岗，需核实是否符合当时政策规定（如医疗期、停薪留职协议等），并保留相关证据。

2. 补正或更正档案材料
   根据《企业职工档案管理工作规定》，档案材料应真实、完整。若发现档案错误，可要求单位通过以下方式补正：

   • 补充证明材料：如考勤记录、工资单、调岗通知、医疗证明等，证明实际在岗情况；
     
   • 申请档案更正：向单位人事部门或档案保管部门提交书面申请，附上证明材料，要求修正错误记录；
     
   • 劳动监察投诉：若单位拒绝更正，可向当地劳动监察部门投诉，要求介入调查并责令整改。

3. 特殊工种认定与权益保障
   特殊工种（如高空、高温、井下等）的工龄认定直接影响退休待遇（如提前退休资格）。若档案中“不在岗”记录导致工龄计算错误，可能损害权益。此时需：

   • 确认政策依据：查阅当地特殊工种认定文件（如行业目录、工龄计算规则），明确“在岗”的具体要求；
     
   • 申请行政复议或诉讼：若单位或社保部门因档案错误拒绝认定特殊工种工龄，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，要求重新核定。

4. 预防与长期管理建议

   • 定期核查档案：建议员工每1-2年向单位申请查阅档案，确保信息准确；
     
   • 保留书面证据：对调岗、休假等关键事项，要求单位出具书面文件并签字盖章；
     
   • 咨询专业律师：若涉及复杂权益争议（如退休待遇损失），可进一步向我咨询具体法律策略。

行动建议：先与单位沟通核实情况，要求补正材料；若无法解决，再通过劳动监察或法律途径维权。如有具体案例细节（如行业、不在岗原因等），可进一步向我说明，以便提供更精准的建议。