签了字的协议，即使证据证明其内容不是事实，也可能在一定情况下作为处理问题的依据。以下是对此问题的详细分析：
协议的法律效力：
- 一般来说，双方自愿签订并签字的协议，在法律上具有约束力。这意味着，即使协议中的某些内容与实际事实不符，但只要双方当时是基于真实意愿签订的，且没有违反法律法规的强制性规定，该协议仍然可能被视为有效。
证据与事实的关系：
- 证据是用来证明事实的材料，但证据本身并不等同于事实。在司法实践中，证据需要被法院审查、认定，才能作为定案的依据。因此，即使有证据证明协议中的某些内容不是事实，这并不意味着协议就完全失去了法律效力。
协议内容的可调整性：
- 如果协议的内容确实与事实不符，且这种不符是由于误解、欺诈、胁迫等不正当手段导致的，那么受影响的一方可以向法院提起诉讼，请求变更或撤销该协议。在这种情况下，协议将不再作为处理问题的依据，或者其效力将受到严重影响。
实际案例中的处理：
- 在实际案例中，法院会根据具体情况来判断协议的法律效力。如果协议内容虽然与事实不符，但双方均认可其效力，且没有违反法律法规的强制性规定，那么法院可能会尊重双方的意愿，确认协议的效力。
综上所述，签了字的协议即使证据证明其内容不是事实，也可能在一定情况下作为处理问题的依据。但具体情况需要根据协议的具体内容、双方的意愿、法律法规的规定以及法院的判断来确定。如果你在这方面有具体的法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的法律建议。