公司转公司的款项一般不能直接算作个人借款，这主要取决于款项的性质、用途以及双方之间的约定。以下从几个不同角度进行分析：

1. 款项性质与用途：

   • 如果公司之间的转账是出于正常的商业交易、投资、合作或资金调配等目的，并且这些转账行为在公司财务记录中有明确的记载和说明，那么这些款项通常不会被视为个人借款。
   • 相反，如果转账行为缺乏合理的商业背景，且款项被用于个人消费、偿还个人债务等非公司业务目的，同时转账双方（尤其是转出方）有明确的个人借款意图，并可能通过某种形式（如口头协议、书面合同等）进行了约定，那么这些款项在特定情况下可能被认定为个人借款。但这种情况较为复杂，需要具体证据支持。

2. 法律关系与责任：

   • 公司之间的转账通常涉及公司法、合同法等法律领域，而个人借款则主要涉及民间借贷法律关系。如果款项被错误地认定为个人借款，可能会导致法律关系的混淆和法律责任的错配。
   • 例如，如果公司之间的转账被认定为个人借款，那么转出方（公司）可能面临无法以公司名义追讨债务的风险，而转入方（个人或另一公司，但在此假设为个人以非法手段获取）则可能面临非法所得的法律责任。

3. 实际操作与证据留存：

   • 在实际操作中，为了避免款项性质被误解或争议，公司之间的转账应当明确记录款项的用途、性质以及双方之间的约定。这可以通过转账备注、合同协议、会议纪要等方式进行留存。
   • 如果确实存在个人借款的情况，应当签订书面借款合同，明确借款金额、期限、利率等关键条款，并保留好转账记录等证据。

4. 特殊情况下的认定：

   • 在某些特殊情况下，如公司实际控制人或股东利用公司账户进行个人借款或资金挪用等行为，这些款项可能被视为个人借款或非法所得。但这种情况需要具体的证据支持，并且可能涉及刑事责任。

建议：

• 对于公司之间的转账行为，应当明确款项的性质和用途，并保留好相关证据。
• 如果确实存在个人借款的需求，应当签订书面借款合同，并遵守相关法律法规的规定。
• 如果对款项性质或法律责任存在疑问，建议及时咨询专业律师（即我本人，董飞律师，专注于股权转让、刑事辩护领域），以便获得更准确的法律意见和指导。