村干部是可以注册建筑公司并自己担任法人的，但在这一过程中，必须严格遵守相关法律法规，并确保合法合规经营，同时妥善平衡村务工作与公司经营之间的关系，以避免任何可能的利益冲突。
首先，从法律层面来看，根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，任何人，包括村干部，只要满足公司注册的基本条件，如股东符合法定人数、有全体股东认缴的出资额、制定公司章程、有公司名称和组织机构、有公司住所等，均可注册公司。同时，《中华人民共和国村民委员会组织法》也并未明确禁止村干部拥有自己的公司。
然而，村干部在注册建筑公司并担任法人时，也需要注意以下几点特殊规定和限制：
村集体相关限制：村干部需要仔细审查所在村集体的规章制度、村规民约等，确保没有禁止或限制村干部注册与村集体利益有冲突公司的条款。如果存在这样的规定，村干部必须遵守，以避免违规操作。
廉洁纪律要求：村干部在经商办企业过程中，必须严格遵守党纪政纪和廉洁自律要求。他们不得利用职务便利为公司谋取不正当利益，防止权力寻租等违法行为的发生。这是维护村干部形象和村务工作公正性的重要一环。
时间管理：村干部需要合理安排时间，确保不因个人公司事务而长时间脱离村务工作。他们必须保证有足够的时间和精力来履行村干部的职责，确保村务的正常开展。
此外，村干部在注册和经营建筑公司时，还需要特别注意以下几点：
信息公开与透明：为了增强村民的信任和理解，村干部应将注册公司的情况向村民公开，说明公司经营业务与村务之间不存在利益冲突。这有助于维护村务工作的透明度和公正性。
避免利益冲突：村干部在经营公司时，应严格区分公司事务与村务。他们不得利用职务之便为公司谋取不当利益，也不得让公司业务干扰到村务的正常进行。这是维护村务工作秩序和村民合法权益的重要保障。
遵守相关法律法规：除了《公司法》外，村干部在注册和经营公司过程中还需遵守《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规。他们必须确保不损害村民集体利益，不违规使用村集体资源。
综上所述，村干部在注册建筑公司并担任法人时，需要全面了解和遵守相关法律法规及村规民约，确保行为的合法性和合规性。同时，通过信息公开、避免利益冲突等措施，维护村务工作的正常秩序和村民的合法权益。