结论：劳动争议中，即使公司缺席，仲裁庭也不会仅以超过仲裁时效为由驳回申请，但若确实超过仲裁时效且无合理理由，仲裁请求可能被驳回。以下是对此问题的详细分析：

1. 仲裁时效的基本规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》及相关规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，自当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。这是保护劳动者权益、促使及时行使权利的重要制度设计。

2. 公司缺席对仲裁的影响：

   • 公司缺席仲裁庭审，并不影响仲裁程序的进行。根据法律规定，被申请人收到书面通知，无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，仲裁庭可以缺席裁决。这意味着，即使公司不参与仲裁，仲裁庭仍会根据现有证据和法律规定作出裁决。

3. 超过仲裁时效的后果：

   • 若劳动者的仲裁请求确实超过了仲裁时效，且没有合理的理由（如不可抗力等）导致时效中断或中止，那么仲裁庭在审查后，可能会以超过仲裁时效为由驳回仲裁请求。但这一驳回决定是基于时效问题的实质审查，而非仅仅因为公司缺席。

4. 仲裁请求被驳回的其他可能原因：

   • 除了超过仲裁时效外，仲裁请求还可能因其他原因被驳回，如主体不适格、仲裁请求不明确或缺乏事实依据、不属于劳动争议仲裁受理范围、违反法定程序等。这些原因与是否超过仲裁时效无关，但同样可能导致仲裁请求被驳回。

5. 应对建议：

   • 及时行使权利：劳动者应在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请，避免因超过时效而丧失权利。
   • 准备充分证据：在提出仲裁申请时，应确保仲裁请求具体、明确，并充分收集相关证据以支持主张。
   • 了解仲裁程序：遵守法定程序，按规定提交申请材料，按时参加庭审，避免因程序问题导致申请被驳回。
   • 寻求专业帮助：如有需要，可以向专业律师咨询，以获取更具体的法律建议和帮助，确保自己的权益得到充分保护。

总结：劳动争议中，公司缺席并不会导致仲裁庭仅以超过仲裁时效为由驳回申请。但劳动者仍需注意仲裁时效的问题，及时行使权利，并准备充分证据以支持自己的主张。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。