可以，同一个保险公司可以申请代位追偿，但需满足法定条件且程序合法。以下是具体分析：

1. 代位追偿的法律依据
   根据《中华人民共和国保险法》第六十条，因第三者对保险标的的损害造成保险事故的，保险人（保险公司）自向被保险人赔偿保险金之日起，在赔偿金额范围内代位行使被保险人对第三者请求赔偿的权利。这一规定未限制保险公司与第三者的身份关系，因此同一保险公司作为保险人时，若其承保的保险标的因第三方（包括同一保险公司承保的其他标的或责任）受损，仍可依法主张代位追偿。

2. 同一保险公司申请代位追偿的典型场景

   • 场景一：交叉责任
     若同一保险公司承保了A车（车损险）和B车（第三者责任险），A车因B车过错受损，保险公司向A车赔付后，可向B车的被保险人（即自身承保的另一方）追偿。此时需注意：保险公司内部需区分不同险种的理赔流程，避免利益冲突。
   • 场景二：责任保险中的追偿
     例如，企业投保了财产综合险和公众责任险，因企业过错导致第三方财产损失，保险公司先赔付第三方后，可向企业追偿（若责任险条款约定免赔或企业存在故意行为）。此时代位追偿的对象是同一保险公司的被保险人，但基于不同法律关系（财产险与责任险）。

3. 操作中的关键限制

   • 赔偿先行原则：保险公司必须已实际向被保险人支付赔偿金，否则无权行使代位权。
     
   • 赔偿范围限制：追偿金额不得超过保险公司已支付的赔偿金额，且需以第三者实际责任为限。
     
   • 避免利益冲突：若保险公司同时承保了损害方和受害方的保险，需通过内部风控机制（如独立核赔部门）确保追偿程序公正，防止通过代位追偿转移自身风险。

4. 实务建议

   • 明确合同条款：保险公司应在保单中清晰约定代位追偿的适用条件及程序，避免争议。
     
   • 证据留存：追偿时需提供保险事故认定书、赔付凭证、第三者过错证明等材料。
     
   • 协商优先：若第三者同为保险公司被保险人，可尝试通过内部调解或协议赔付降低诉讼成本。

若您遇到具体案件（如车险代位追偿、责任险追偿等），可进一步说明细节，我将结合案例为您分析操作路径。