关于劳动者主张未签劳动合同双倍工资，用人单位已超过仲裁时效的计算问题，结论如下：

未签劳动合同双倍工资的仲裁时效通常为一年，自劳动者知道或应当知道权利被侵害之日起计算。但具体起算点可能因地区司法实践和案件具体情况有所不同，主要存在逐月计算和整体计算两种方式。

一、仲裁时效的起算点

1. 逐月计算（主流司法实践）

   • 原理：每个月的双倍工资差额被视为独立的债权，因此仲裁时效从对应月份工资支付周期届满的次日开始计算。
   • 示例：若劳动者2023年1月1日入职，用人单位一直未签劳动合同，则双倍工资支付期间为2023年2月1日至2023年12月31日。若2023年2月的工资应于3月发放，且未发放双倍差额，则该月的仲裁时效从2023年4月1日起算一年。以此类推，每个月的双倍工资差额都有其独立的仲裁时效期间。

2. 整体计算（少数地区采用）

   • 原理：将全部未签合同的期间视为一个整体，仲裁时效从最后一个月工资支付周期届满的次日开始计算，或者从劳动关系终止之日起计算。
   • 示例：沿用上述案例，若采用整体计算方式，则仲裁时效从2024年1月1日起算一年（假设劳动关系在此时终止）。

二、仲裁时效的中断与中止

• 中断：在仲裁时效期间内，若劳动者向用人单位主张权利（如讨要双倍工资）、向有关部门请求权利救济（如向劳动监察部门投诉），或者用人单位同意履行义务等情形，仲裁时效中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。
• 中止：因不可抗力或有其他正当理由（如劳动者因重病无法行使权利等），导致劳动者不能在规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。

三、特殊情况说明

• 劳动关系存续期间：若因拖欠劳动报酬（包括双倍工资差额）发生争议，且劳动关系仍在存续期间，劳动者申请仲裁不受一年仲裁时效期间的限制。但劳动关系终止后，劳动者应当自劳动关系终止之日起一年内提出仲裁申请。

四、实务操作建议

1. 及时主张权利：发现未签合同后，劳动者应优先通过协商补签并留存证据；若无法补签，建议在劳动关系解除或终止后一年内尽快申请仲裁，以避免超过仲裁时效。
2. 保留关键证据：包括工资流水、考勤记录、工作证等能证明劳动关系及入职时间的材料，这些证据在仲裁过程中至关重要。
3. 了解地区差异：由于不同地区司法实践存在差异，劳动者在申请仲裁前应了解当地的具体规则和裁判口径，以便更准确地计算仲裁时效和准备相关证据。

总结：未签劳动合同双倍工资的仲裁时效计算是一个复杂且地域性较强的问题。劳动者在面临此类争议时，应充分了解并关注仲裁时效的相关规定，确保在时效期间内及时采取行动以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。