关于工地发生工伤，已有工伤认定书后二次手术费用由谁支付的问题，结论如下：
若用人单位已缴纳工伤保险：
- 费用承担：根据《工伤保险条例》，治疗工伤所需的二次手术费用，若符合工伤保险诊疗项目目录、药品目录及住院服务标准，将由工伤保险基金支付。这包括手术费、药费、住院费等直接医疗费用。
- 其他相关费用：除了直接医疗费用，工伤保险基金还会支付住院伙食补助费、交通食宿费等因工伤产生的其他费用。同时，工伤职工在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
若用人单位未缴纳工伤保险：
- 费用承担：若用人单位未依法为职工缴纳工伤保险费，则所有因工伤产生的二次手术费用及其他相关费用，均需由用人单位自行承担。这是依据《工伤保险条例》第六十二条的规定执行的。
若存在第三人侵权的情况：
- 费用承担：如工伤系由第三人侵权导致，根据《中华人民共和国民法典》等法律规定，侵权第三人应承担民事赔偿责任，包括二次手术费用。同时，即使职工已获得第三人赔偿，仍可享受工伤保险待遇的差额部分（具体依当地规定）。这意味着，在第三人赔偿不足的情况下，工伤保险基金将补充支付剩余费用。
若二次手术并非因工伤直接导致：
- 费用承担：若二次手术并非因工伤直接导致，或不符合工伤保险的相关规定，费用则需由职工个人或其所在单位协商承担。在此情况下，建议职工与单位积极沟通，争取获得必要的支持。
法律建议：
- 在处理此类问题时，首先应确认用人单位是否已缴纳工伤保险费，以及工伤的具体原因。
- 若用人单位已缴纳工伤保险，且二次手术属于工伤治疗的必要部分，则应及时向工伤保险基金申请支付相关费用。
- 若用人单位未缴纳工伤保险，或存在第三人侵权的情况，则应根据具体情况向用人单位或侵权人主张权利。
- 对于复杂或争议较大的案件，建议保留好相关证据，如工伤认定书、医疗费用发票等，以便在需要时向劳动保障部门或专业律师咨询，确保权益得到充分保障。
可能遇到的法律后果：
- 若用人单位未依法缴纳工伤保险费，除了需自行承担工伤费用外，还可能面临社会保险行政部门的处罚，包括责令限期参加、补缴工伤保险费及滞纳金，甚至罚款。
- 若因工伤费用承担问题产生争议，且无法通过协商解决，则可能需要通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来解决。
希望以上解答能对您有所帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。