结论：违反土地管理法的土地买卖使用权协议，一般不具有排除妨碍权。以下从多个角度进行详细分析：

一、法律角度

1. 协议效力问题：

   • 根据《土地管理法》的相关规定，农村土地，特别是宅基地，其使用权受到严格限制，不得随意买卖。违反法律强制性规定的土地买卖使用权协议，通常会被认定为无效协议。
   • 无效的协议自始不具有法律效力，因此，基于该协议产生的任何权利，包括排除妨碍权，都不会得到法律的支持。

2. 排除妨碍权的法律依据：

   • 排除妨碍权通常与物权相关，特别是所有权或使用权。在合法的土地使用权范围内，如果受到他人非法妨碍，使用权人有权请求排除妨碍。
   • 然而，在违反土地管理法的土地买卖使用权协议中，由于协议本身无效，因此无法基于该协议主张排除妨碍权。

二、实践角度

1. 土地管理部门的干预：

   • 对于违反土地管理法的土地买卖行为，土地管理部门有权进行查处，并可能采取强制措施恢复土地原状。
   • 在这种情况下，即使买卖双方签订了协议，也无法对抗土地管理部门的合法干预，更无法主张排除妨碍权。

2. 司法实践中的处理：

   • 在司法实践中，法院通常会认定违反土地管理法的土地买卖使用权协议无效，并驳回基于该协议提出的排除妨碍等诉讼请求。
   • 法院的判决会基于法律的规定和公共利益的需要，维护土地管理的秩序和法律的权威。

三、建议与风险提示

1. 遵守法律法规：

   • 在进行土地买卖或使用权转让时，务必遵守《土地管理法》等相关法律法规的规定，确保交易的合法性和有效性。
   • 避免签订违反法律强制性规定的协议，以免面临法律风险和损失。

2. 寻求法律帮助：

   • 如果对土地买卖或使用权转让的法律问题存在疑问或困惑，建议及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。
   • 律师可以根据具体情况提供法律建议，帮助规避法律风险，维护合法权益。

3. 风险提示：

   • 违反土地管理法的土地买卖行为不仅可能导致协议无效，还可能面临行政处罚甚至刑事责任。
   • 因此，务必谨慎对待土地买卖问题，切勿因小失大，触犯法律红线。

综上所述，违反土地管理法的土地买卖使用权协议不具有排除妨碍权。在进行土地交易时，请务必遵守相关法律法规的规定，确保交易的合法性和有效性。如有任何法律问题或困惑，请直接向我咨询。