违约金单独约定，通常指的是在合同中双方就违约金条款进行的具体、明确的约定，而非指法院在调解书中单独写一个条款。以下是对这一问题的详细解释：
合同中的单独约定：
- 在合同中，双方可以就违约金的数额、计算方式、支付条件等具体事项进行明确约定。这种约定是双方自愿、平等协商的结果，具有法律约束力。
- 例如，在一份买卖合同中，双方可以约定：“如果买方未按时支付货款，应按照未支付金额的每日千分之一向卖方支付违约金。”这就是一个具体的违约金单独约定。
法院调解书中的条款：
- 法院调解书是在诉讼过程中，双方当事人在法院的主持下，通过协商达成的和解协议。调解书中的条款是双方妥协的结果，旨在解决纠纷，恢复社会关系。
- 虽然调解书中也可能包含违约金的条款，但这并不是“违约金单独约定”的通常含义。调解书中的违约金条款更多是基于双方在诉讼过程中的妥协和让步，而非合同签订时的原始约定。
- 法院在调解书中写入违约金条款，通常是为了确保调解协议的履行，对违约方进行一定的制约和惩罚。但这种条款并不是合同中的原始约定，而是诉讼过程中的一种法律安排。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。这为合同中的违约金约定提供了法律依据。
- 建议：在签订合同时，双方应充分协商，明确违约金的数额、计算方式、支付条件等具体事项，以确保合同的顺利履行和纠纷的有效解决。如果发生纠纷并进入诉讼程序，双方也可以在法院的主持下进行调解，但调解书中的违约金条款应基于双方的妥协和让步，而非简单地复制合同中的原始约定。
可能的法律后果：
- 如果合同中的违约金约定过高或过低，一方可以请求法院或仲裁机构予以调整。法院或仲裁机构会根据实际情况，结合违约方的过错程度、守约方的实际损失等因素，对违约金数额进行合理调整。
- 如果一方违反合同中的违约金约定，另一方有权要求其支付违约金，并可能通过法律途径追究其违约责任。
综上所述，违约金单独约定通常指的是在合同中双方就违约金条款进行的具体、明确的约定。如有任何合同纠纷或法律疑问，可以直接向我咨询。