员工在孕晚期休假是否有工资，需根据具体的休假类型来确定。以下是对不同休假类型下工资支付情况的详细分析：

1. 法定产假期间：

   • 根据《女职工劳动保护特别规定》，女职工生育享受98天产假，特殊情况下如难产或多胞胎生育，产假时间还会相应增加。在产假期间，女职工有权获得工资或生育津贴。
   • 若女职工所在用人单位已为其按时足额缴纳生育保险费，则产假期间可享受生育津贴，由生育保险基金按照用人单位上年度职工月平均工资的标准支付。若生育津贴高于女职工产假前工资标准，用人单位不得克扣；若低于女职工产假前工资标准，差额部分由用人单位补足。
   • 若用人单位未给女职工缴纳生育保险费，则女职工产假期间的工资由用人单位按照女职工产假前工资的标准支付。

2. 产前检查假期间：

   • 怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间计入劳动时间，即视为正常出勤。因此，用人单位应按照正常出勤的标准支付工资，不得以请假为由扣发工资。例如，若女职工每月需进行产前检查，每次检查花费的半天时间应视为正常出勤，公司应正常发放这半天的工资。

3. 保胎假期间：

   • 若女职工按计划生育怀孕，并经过医师开具证明需要保胎休息的，其保胎休息的时间通常按照病假来处理。用人单位应按照本单位实行的疾病待遇规定，即病假工资的标准发放工资。关于病假工资的具体数额，各地规定有所不同，但一般不得低于当地最低工资标准的80%。例如，若某地最低工资标准为每月2000元，则员工保胎请病假期间，用人单位支付的工资每月不得低于1600元。

4. 事假期间：

   • 如果女职工在孕晚期因个人原因请事假，由于事假并非法定的带薪休假，用人单位可以不支付事假期间的工资。事假的批准及工资支付方式，通常按照用人单位的规章制度执行。但建议用人单位在处理此类情况时，应充分考虑女职工的实际情况，尽量给予一定的理解和支持。

特殊保护规定：

• 根据《女职工劳动保护特别规定》，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退或解除劳动（聘用）合同。同时，对于怀孕7个月以上的女职工，用人单位不得延长劳动时间或安排夜班劳动，并应在劳动时间内安排一定的休息时间。若怀孕女职工不能适应原劳动，用人单位应根据医疗机构的证明，予以减轻劳动量或安排其他能够适应的劳动。

总结与建议：

• 女职工在孕晚期休假时，其工资支付情况需根据具体休假类型确定。用人单位应遵守相关法律法规，确保女职工在孕期的合法劳动权益得到保障。
• 若女职工在孕晚期遇到工资支付问题，建议首先与用人单位进行沟通协商，寻求解决方案。若协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。

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