农村宅基地父母写遗嘱把房屋及所有院子留给一个儿子，在符合法定条件的情况下是有效的。以下从多个角度进行分析：
一、遗嘱有效的法定条件
遗嘱人必须具有遗嘱能力：即遗嘱人必须是完全民事行为能力人，能够清楚表达自己的意愿。如果父母在立遗嘱时已经丧失了民事行为能力，比如患有严重的精神疾病，那么所立的遗嘱将是无效的。
遗嘱必须是遗嘱人的真实意思表示：遗嘱内容必须是遗嘱人自愿、真实地表达，没有受到欺诈、胁迫等不正当手段的影响。如果遗嘱是在被胁迫或欺诈的情况下订立的，那么该遗嘱也是无效的。
遗嘱内容必须合法：遗嘱内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。在农村宅基地的继承问题上，虽然宅基地本身不能作为遗产继承，但宅基地上的房屋是可以继承的。因此，如果遗嘱中明确将房屋及院子（即宅基地上的附属物）留给一个儿子，且该房屋是父母合法拥有的，那么这部分内容是合法的。
遗嘱形式必须合法：根据《民法典》的规定，遗嘱有自书遗嘱、代书遗嘱、打印遗嘱、录音录像遗嘱、口头遗嘱、公证遗嘱等多种形式。无论采用哪种形式，都必须符合法律规定的要件，比如自书遗嘱需要遗嘱人亲笔书写、签名并注明日期；代书遗嘱需要有两个以上见证人在场见证等。
二、农村宅基地的特殊性
宅基地使用权不能继承：农村宅基地属于集体所有，农民只有使用权，没有所有权。因此，宅基地本身不能作为遗产进行继承。但是，宅基地上的房屋是农民的私有财产，可以依法继承。
“地随房走”原则：在继承宅基地上的房屋时，由于房屋与宅基地不可分割，因此继承人实际上也获得了宅基地的使用权。但这种使用权是有限的，仅限于继承房屋所占用的宅基地范围，且不能改变宅基地的用途。
三、实际操作中的注意事项
明确遗嘱内容：在立遗嘱时，应明确写明将房屋及院子（即宅基地上的附属物）留给哪个儿子，避免产生歧义。
办理相关手续：如果遗嘱涉及房屋的过户等手续，应在遗嘱生效后及时办理相关手续，以确保继承人的合法权益得到保障。
考虑其他继承人的权益：如果父母还有其他子女或继承人，且他们可能对遗嘱内容有异议，那么在立遗嘱时应考虑与他们进行沟通协商，以避免后续产生纠纷。
总结来说，农村宅基地父母写遗嘱把房屋及所有院子留给一个儿子，在符合上述法定条件的情况下是有效的。但需要注意的是，由于农村宅基地的特殊性，遗嘱内容应明确且合法，且在实际操作中应办理相关手续并考虑其他继承人的权益。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。