在农村土地承包合同期内，若他人未经允许清理了地上物，您有权通过法律途径追究其责任，具体可从以下角度分析和处理：

1. 明确侵权主体与行为性质
   首先需确认清理地上物的主体是谁（如村委会、其他村民、企业等），以及其行为是否构成侵权。根据《民法典》第1165条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应承担侵权责任。若对方无合法依据（如未取得您同意、未通过法定程序）擅自清理，即构成侵权。

2. 收集关键证据
   证据是维权的核心，需重点收集以下材料：

   • 土地承包合同：证明您对土地的合法承包经营权及合同期限；
     
   • 地上物权属证明：如种植作物、建造设施的购买凭证、照片、视频等，证明地上物归您所有；
     
   • 侵权行为证据：清理现场的照片、视频、证人证言等，证明对方实施了清理行为；
     
   • 损失评估报告：若可能，委托第三方机构评估地上物的经济价值，为索赔提供依据。

3. 追究责任的途径

   • 协商调解：可先与侵权方沟通，要求其停止侵害、恢复原状或赔偿损失。若对方是村委会或集体组织，可申请乡镇政府调解；
     
   • 行政投诉：若侵权方是行政机关（如乡镇政府）或其工作人员，可向其上级机关申请行政复议，或通过信访渠道反映问题；
     
   • 民事诉讼：若协商、调解无果，可直接向法院提起民事诉讼，主张侵权赔偿。根据《民法典》第1184条，赔偿范围包括地上物的直接损失（如作物价值、设施重置成本）及间接损失（如预期收益）。

4. 特殊情形处理

   • 若涉及集体土地征收：若清理行为与政府征收程序相关，需核实征收是否合法（如是否发布征收公告、是否签订补偿协议）。若征收程序违法，可同时主张行政赔偿；
     
   • 若合同有特别约定：检查承包合同中是否约定了地上物保护条款或违约责任。若有，可依据合同主张对方违约，要求承担违约责任。

行动建议：

1. 立即固定证据（如拍照、录像、联系证人），避免证据灭失；
   
2. 根据侵权方身份和行为性质，选择协商、投诉或诉讼途径；
   
3. 若损失较大或情况复杂，建议委托律师协助处理，以确保程序合法、赔偿充分。
   

如有进一步细节（如侵权方身份、地上物类型、合同条款等），可随时向我补充说明，我会为您制定更具体的维权方案。