在法院判决书中，若仅提及有关行政部门认定违章建筑并判拆除，但未写明具体是哪一级行政部门，这确实可能给执行带来一定的困惑。不过，我们可以从法律框架和实际操作的角度来分析这个问题：

1. 法律框架下的行政部门层级：

   • 在我国，违章建筑的认定和拆除通常涉及多个层级的行政部门，包括但不限于城市规划部门、城市管理综合执法部门（或称为城管部门）、以及可能的地方政府或其授权的部门。
   • 具体到哪一级行政部门负责，往往取决于违章建筑的性质、规模、所在地区以及相关法律法规的具体规定。例如，在城市规划区内，可能主要由城市规划部门负责；而在一些特定区域或针对特定类型的违章建筑，地方政府或其授权的部门可能直接介入。

2. 法院判决中的行政部门指定：

   • 法院在判决中通常会明确指出负责执行拆除的行政部门，以确保判决的明确性和可执行性。如果判决书中未明确指定，这可能是由于判决书表述上的疏忽或遗漏。
   • 在这种情况下，当事人或执行机关可以依据相关法律法规和判决书的整体精神，结合实际情况，推断出最有可能负责执行的行政部门。例如，如果违章建筑位于城市规划区内，且涉及城市规划问题，那么城市规划部门很可能是负责执行的部门。

3. 实际操作中的建议：

   • 查阅相关法律法规：首先，建议查阅与违章建筑认定和拆除相关的法律法规，特别是地方性的法规或规章，以了解具体负责执行的行政部门。
   • 咨询法院或执行机关：如果法律法规中未明确规定或存在模糊之处，可以咨询作出判决的法院或负责执行判决的机关（如法院执行局），以获取更具体的指导。
   • 与行政部门沟通：在确定了可能的负责部门后，可以与该部门进行沟通，确认其是否负责执行拆除，并了解具体的执行程序和要求。

4. 可能的法律后果：

   • 如果因判决书未明确指定行政部门而导致执行困难或延误，当事人可以向法院申请执行异议或寻求其他法律救济途径。
   • 同时，负责执行的行政部门也应积极履行职责，确保判决得到有效执行。如果行政部门因故意或过失导致判决未得到执行，可能面临法律责任。

总结来说，虽然法院判决书中未明确写明负责拆除违章建筑的行政部门可能带来一定的困惑，但通过查阅相关法律法规、咨询法院或执行机关以及与行政部门沟通等方式，我们仍然可以确定负责执行的部门并推动判决的执行。如果在这个过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。