结论：先签订合作协议，在履约过程中隐瞒收款事实并继续占有相关款项，是否构成合同诈骗，需结合具体情形判断，但该行为存在构成合同诈骗罪的可能性。以下从不同角度进行分析：
一、合同诈骗罪的构成要件
合同诈骗罪是指以非法占有为目的，在签订、履行合同过程中，采取虚构事实或者隐瞒真相等欺骗手段，骗取对方当事人的财物，数额较大的行为。其构成要件主要包括：
- 主观方面：具有非法占有的目的。即行为人明知自己没有履行合同的能力或者根本不打算履行合同，而通过签订、履行合同的方式骗取对方财物。
- 客观方面：在签订、履行合同过程中，采取虚构事实或者隐瞒真相等欺骗手段，骗取对方当事人的财物，且数额较大。
二、具体行为分析
隐瞒收款事实：
- 如果行为人在签订合作协议时，就意图通过隐瞒收款事实来非法占有对方款项，且在履约过程中持续实施这一行为，那么这种行为很可能构成合同诈骗罪中的“隐瞒真相”手段。
- 如果行为人最初并无非法占有目的，但在履约过程中因各种原因（如资金链断裂、经营不善等）产生非法占有目的，并隐瞒收款事实，也可能构成合同诈骗罪，但需结合其他证据综合判断。
继续占有款项：
- 行为人隐瞒收款事实后，继续占有对方款项，且没有合理的解释或归还计划，这进一步表明其具有非法占有的目的。
- 如果行为人能够证明其继续占有款项是出于其他合法目的（如暂时保管、等待对方指示等），且最终能够归还或按照合同约定处理，则可能不构成合同诈骗罪。
三、数额与情节
- 数额较大：合同诈骗罪的成立还要求骗取的财物数额较大。具体数额标准可能因地区而异，需参照当地的相关司法解释或规定。
- 情节严重：除了数额较大外，如果行为人的诈骗手段特别恶劣、造成严重后果或者具有其他严重情节，也可能构成合同诈骗罪。
四、法律建议
- 收集证据：如果怀疑对方构成合同诈骗罪，应尽快收集相关证据，如合作协议、付款记录、沟通记录等，以证明对方的欺骗行为和非法占有目的。
- 报警处理：在收集到足够证据后，可以向公安机关报案，由公安机关进行立案侦查。
- 民事诉讼：同时，也可以考虑通过民事诉讼的方式要求对方返还被骗款项，并承担违约责任或赔偿责任。
五、可能后果
- 刑事责任：如果对方构成合同诈骗罪，将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。
- 民事责任：无论对方是否构成犯罪，都可能需要承担民事责任，如返还被骗款项、赔偿损失等。
总结：先签订合作协议，在履约过程中隐瞒收款事实并继续占有相关款项，是否构成合同诈骗罪需结合具体情形判断。如果怀疑对方构成犯罪，建议尽快收集证据并报警处理。同时，也可以考虑通过民事诉讼的方式维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。