若发现被告上诉程序违法，可采取以下措施来维护合法权益：

1. 及时提出异议：

   • 在上诉程序进行中，如果发现对方上诉存在程序违法的情况，如超过上诉期限、未按规定提交上诉状等，应当及时向受理上诉的法院提出书面异议。异议内容应明确指出对方上诉程序中的违法点，并附上相关证据材料，如上诉期限的计算依据、上诉状提交时间的证明等。
   • 法院在收到异议后，会进行审查。如果异议成立，法院可能会裁定驳回对方的上诉，从而维护你的合法权益。

2. 申请法院审查：

   • 除了直接提出异议外，你还可以向法院申请对上诉程序进行审查。这通常涉及向法院提交一份详细的申请书，说明对方上诉程序违法的具体情况，以及要求法院采取的措施，如撤销上诉、维持原判等。
   • 法院在收到申请后，会进行全面的审查，并根据审查结果作出相应的裁定或判决。

3. 关注上诉案件进展，准备后续应对：

   • 在提出异议或申请审查的同时，应密切关注上诉案件的进展情况。如果法院对异议或申请进行了审查并作出了裁定，要及时了解裁定内容，并根据裁定结果准备后续的应对措施。
   • 如果法院裁定驳回对方的上诉，那么原判决将继续有效，你可以按照原判决执行。如果法院裁定对方的上诉有效，那么案件将进入二审程序，你需要准备相应的答辩材料，积极参与二审诉讼。

4. 寻求法律救济途径：

   • 如果认为法院在处理上诉程序违法问题上存在错误或不当行为，还可以考虑通过法律救济途径来维护自己的权益。这可能包括向上一级法院申请再审、向检察机关申请抗诉等。
   • 在选择法律救济途径时，要仔细研究相关法律规定和程序要求，确保自己的申请符合法律条件，并准备好充分的证据材料来支持自己的主张。