结论：交通事故发生后，受害人二次住院治疗自身疾病产生的医疗费用是否由侵权人全部赔偿，需根据具体情况综合判断，并非一定由侵权人全部赔偿。以下从不同角度进行分析：
一、侵权人责任角度
交通事故直接导致伤害未痊愈：
- 若二次住院是由于交通事故直接导致的伤害未痊愈而需继续治疗，且肇事者在事故中负有责任（无论是全责、主要责任、同等责任还是次要责任），则肇事者应承担相应的赔偿责任。赔偿范围包括但不限于与交通事故损伤直接相关的医疗费、护理费、交通费等。
- 举例：甲驾车与乙发生碰撞，导致乙腿部受伤。乙首次治疗后，因腿部伤势未痊愈需二次住院治疗。此时，甲作为肇事者，应承担乙二次住院治疗腿部伤势的医疗费用。
侵权人责任比例：
- 如果受害人对事故的发生也存在过错，需根据自身过错程度承担相应比例的第二次治疗费用。根据《中华人民共和国民法典》第一千一百七十三条，被侵权人对同一损害的发生或者扩大有过错的，可以减轻侵权人的责任。
- 举例：戊在交通事故中承担30%责任，己承担70%责任。若戊因交通事故导致的伤势需二次住院治疗，花费1万元，则己需承担7000元，戊自己承担3000元。
二、保险公司责任角度
交强险与商业三者险：
- 在肇事车辆投保了交强险和商业三者险的情况下，保险公司应首先在保险责任限额范围内对二次住院产生的合理费用进行赔偿。交强险先行赔付，超出部分再由商业三者险按事故责任比例赔付。
- 举例：甲驾车与乙发生碰撞，甲车投保了交强险和保额为100万的商业三者险。乙首次治疗花费5万元，其中交强险赔付1.8万元，商业三者险赔付3.2万元。若乙后续治疗再花费2万元，且这2万元与交通事故损伤直接相关，则这2万元将由商业三者险赔付。
保险赔偿范围限制：
- 保险公司仅对与交通事故损伤直接相关的医疗费用进行赔偿。若二次住院治疗的是受害人自身疾病，且该疾病与交通事故无直接因果关系，则保险公司可能不予赔偿。
三、受害人自身疾病与交通事故关系角度
自身疾病与交通事故无直接因果关系：
- 若二次住院治疗的是受害人自身疾病，且该疾病与交通事故无直接因果关系，则相关医疗费用可能需由受害人自行承担。
- 举例：乙在交通事故中仅受轻微擦伤，但乙本身患有严重的心脏病。交通事故后，乙因心脏病发作需二次住院治疗。此时，乙二次住院治疗心脏病的医疗费用与交通事故无直接因果关系，可能需由乙自行承担。
自身疾病与交通事故有间接因果关系：
- 若二次住院治疗的是受害人自身疾病，但该疾病与交通事故存在间接因果关系（如交通事故导致受害人身体虚弱，进而引发自身疾病），则可能需根据具体情况判断侵权人是否应承担部分赔偿责任。
四、特殊情况处理
医疗过错导致二次住院：
- 若医院在第一次治疗过程中存在医疗过错导致二次住院，医院应承担相应赔偿责任。此时，需通过医疗事故鉴定等程序确定责任程度。
争议处理与法律诉讼：
- 若双方对事故责任划分、医疗费用合理性等存在争议，可请求交警部门介入调查并出具责任认定书，作为划分赔偿责任的依据。若协商不成，受害者可向人民法院提起诉讼，要求侵权人承担相应的赔偿责任。
五、建议措施
- 保留证据：在治疗过程中，受害人应妥善保留所有相关的医疗记录和费用票据，以便后续协商或诉讼时使用。
- 先行协商：建议受害人与对方和保险公司进行协商，尝试达成赔偿协议。
- 法律维权：若协商无果，受害人可通过法律途径维护自身权益，如提起诉讼或寻求法律援助。
总结：交通事故发生后，受害人二次住院治疗自身疾病产生的医疗费用是否由侵权人全部赔偿，需根据事故责任、保险情况、受害人自身疾病与交通事故的关系等多个因素综合判断。在处理此类问题时，建议受害人保持冷静，积极收集证据，并寻求专业法律意见以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。