针对您提出的“如果一个协议只签字没有盖章是否生效”的问题，这确实是一个涉及合同法律效力的重要问题。以下是我根据相关法律法规和实务经验，为您提供的详细解答：
一、基本结论
在多数情况下，只签字未盖章的协议仍然有可能生效，但具体效力还需根据协议的特殊约定、协议主体的性质以及协议内容的合法性等因素来综合判断。
二、法律依据与分析
签字的法律效力：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，签字是合同当事人表达认可并愿意受合同条款约束的重要方式。签字具有与盖章、按指印同等的法律效力。因此，在大多数情况下，只要协议内容合法、双方意思表示真实，并且以书面形式订立，签字即可使协议成立并生效。
盖章的法律意义：
- 盖章通常代表公司或组织对协议的确认和授权，对于法人或其他组织而言，盖章是其对外进行意思表示的主要方式。然而，并非所有协议都必须盖章才有效，特别是在个人与个人之间的协议中，盖章并非必需。
协议生效的要素：
- 协议要生效，必须满足以下基本要素：协议主体具备相应的民事行为能力；协议内容是双方真实意思的表示；协议不违反法律法规的强制性规定；协议符合法定的形式要求，通常是书面形式。在这些要素中，签字是形式要求的一部分，而盖章则可能因具体情况而异。
三、特殊情况分析
特殊约定：
- 如果协议中明确约定“本协议需经双方签字并盖章后生效”，则仅签字而未盖章可能导致协议不成立或效力存在瑕疵。在此情况下，双方应严格遵守协议约定，确保协议生效条件的满足。
协议主体：
- 对于自然人而言，签字通常即可表达其真实意愿，除非双方另有约定或交易习惯要求盖章。
- 对于法人或其他组织，如果其内部规定或行业惯例要求盖章，则未盖章可能影响协议的效力。但只要签字人具备合法授权，且协议内容合法，仅签字未盖章的协议仍有可能被认定为有效。
协议内容：
- 协议内容的合法性是决定协议效力的关键因素。如果协议内容本身违反了法律法规的强制性规定，或者存在欺诈、胁迫等导致协议无效的情形，那么无论是否签字或盖章，该协议均属无效。
四、总结与建议
明确约定：
- 在签订协议时，建议双方明确约定协议的生效条件，包括是否需要签字、盖章或按指印等。这有助于避免后续因生效条件不明确而产生的纠纷。
仔细审查：
- 在签订协议前，应仔细审查协议内容以确保其合法性。同时，对于协议主体的身份和签字/盖章的真实性也应进行严格核实。
咨询专业意见：
- 如果对协议的效力存在疑问或担忧，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
综上所述，只签字未盖章的协议能否生效需根据具体情况判断。在实际操作中，应遵循法律法规的规定，并结合协议的具体内容和签署方式来确定协议的效力。