结论：在母亲遗嘱将房产留给女儿，而父亲仍在世的情况下，房产的继承问题需根据遗嘱的具体内容、房产的性质（是否为夫妻共同财产）以及父亲是否放弃或丧失继承权等多方面因素来综合判断。以下是对此问题的详细分析：

一、遗嘱的效力与房产性质

1. 遗嘱的合法性：

   • 首先，需要确认母亲的遗嘱是否合法有效。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，遗嘱应当符合法定形式，如自书遗嘱、代书遗嘱、录音遗嘱、口头遗嘱等，且遗嘱人必须具有完全民事行为能力，遗嘱内容必须是其真实意思表示。

2. 房产的性质：

   • 房产是否属于夫妻共同财产是关键。如果房产是母亲在婚姻关系存续期间取得的，且没有特殊约定，那么该房产通常视为夫妻共同财产。在这种情况下，母亲只能处分自己拥有的那一部分房产份额，而不能处分整个房产。
   • 如果房产是母亲婚前个人财产，或者婚后有明确约定为母亲个人所有，那么母亲有权通过遗嘱处分整个房产。

二、父亲的继承权

1. 法定继承与遗嘱继承：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的规定，继承开始后，按照法定继承办理；有遗嘱的，按照遗嘱继承或者遗赠办理。因此，如果母亲的遗嘱合法有效，且房产属于其可处分的范围，那么女儿将按照遗嘱继承房产。
   • 然而，如果房产是夫妻共同财产，母亲只能处分自己的一半份额，父亲作为另一半份额的共有人，其继承权不受母亲遗嘱的影响。在这种情况下，父亲仍然有权继承其应得的份额，除非他明确表示放弃继承权。

2. 父亲放弃或丧失继承权：

   • 如果父亲在遗嘱生效前明确表示放弃继承权，或者因法定原因（如故意杀害被继承人、遗弃被继承人等）丧失继承权，那么女儿将继承整个房产（如果房产属于母亲可处分的范围）。
   • 如果父亲未放弃继承权且未丧失继承权，那么在处理房产时，需要先分割出父亲的份额，剩余部分再按照遗嘱由女儿继承。

三、实际操作建议

1. 确认遗嘱的合法性：

   • 建议女儿先确认母亲的遗嘱是否合法有效，包括遗嘱的形式、内容以及遗嘱人的民事行为能力等。

2. 了解房产性质：

   • 女儿需要了解房产是否属于夫妻共同财产，以及母亲在房产中的具体份额。这可以通过查阅房产证、购房合同等相关文件来确认。

3. 与父亲协商：

   • 如果房产涉及父亲的份额，女儿应与父亲进行协商，了解他的意愿和态度。如果父亲愿意放弃继承权或达成其他协议，可以签订书面协议并办理相关手续。

4. 办理继承手续：

   • 在确认遗嘱合法有效且房产性质明确后，女儿可以按照遗嘱或法定继承的规定办理继承手续。这可能包括办理房产过户、缴纳相关税费等。

最后，如果女儿在处理此类问题时遇到任何疑问或困难，可以直接向我咨询。我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。