事业单位土地被占用，可依法通过以下途径维护权益：

1. 确认土地权属与占用性质
   首先需明确土地权属（如国有土地使用权证、划拨决定书等），并确认占用行为是否合法。若占用方无合法手续（如未取得征地批复、未签订补偿协议、未支付补偿款等），则属于违法占用，事业单位有权要求其停止侵害、恢复原状或赔偿损失。

2. 协商与行政投诉

   • 协商解决：可先与占用方沟通，要求其停止占用并协商补偿方案（如土地租金、青苗补偿、搬迁费用等）。
     
   • 行政投诉：若协商无果，可向当地自然资源部门（原国土局）、规划部门或综合执法部门举报，要求其履行监管职责，查处违法占用行为（如责令退还土地、拆除违建、罚款等）。

3. 提起民事诉讼
   若占用行为导致事业单位财产损失（如土地收益减少、地上附着物损毁等），可直接向法院提起民事侵权诉讼，要求占用方赔偿损失。需准备证据包括：土地权属证明、占用现场照片/视频、损失评估报告等。

4. 申请行政复议或诉讼（针对行政行为）
   若占用行为涉及行政机关的审批或强制措施（如征地批复、强制拆除等），且事业单位认为该行为违法，可在知道该行为之日起60日内申请行政复议，或6个月内直接提起行政诉讼，要求撤销违法行政行为并赔偿损失。

5. 特殊情形处理

   • 历史遗留问题：若土地权属存在争议（如未确权、历史划拨不清等），需先通过行政确权程序明确权属，再主张权利。
     
   • 公益性占用：若占用方为政府或公共项目（如修路、建学校等），事业单位可要求依法征收并给予合理补偿，而非直接要求返还土地。

行动建议：

• 立即收集证据（如土地证、占用现场记录、沟通记录等），避免证据灭失；
  
• 根据占用性质选择合适途径（如违法占用优先行政投诉，侵权损失优先民事诉讼）；
  
• 若涉及复杂法律程序（如行政诉讼、权属确权），建议委托律师协助处理，以提高维权效率。
  

如有进一步细节（如占用方身份、土地用途、是否涉及征收等），可向我补充说明，以便提供更精准的建议。